More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1976 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  100 
 
 		 284 aa  583  1.0000000000000001e-165  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  98.94 
 
 		 284 aa  577  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  78.99 
 
 		 266 aa  395  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  73.17 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  68.91 
 
 		 261 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  68.49 
 
 		 261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  68.07 
 
 		 311 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  66.81 
 
 		 261 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  63.79 
 
 		 265 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  57.89 
 
 		 265 aa  321  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  59.39 
 
 		 260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  65.13 
 
 		 256 aa  318  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  59 
 
 		 260 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  66.26 
 
 		 259 aa  314  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  65.43 
 
 		 259 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  58.24 
 
 		 260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  58.24 
 
 		 260 aa  312  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  61.34 
 
 		 257 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  57.09 
 
 		 260 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  60.5 
 
 		 256 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  60.5 
 
 		 256 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  60.5 
 
 		 256 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  59.75 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  57.85 
 
 		 257 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  57.09 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  58.82 
 
 		 256 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  58.58 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  53.41 
 
 		 266 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  58.4 
 
 		 262 aa  285  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  56.25 
 
 		 261 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  56.25 
 
 		 261 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  57.5 
 
 		 261 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  52.56 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  50.57 
 
 		 278 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  50.19 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  48 
 
 		 273 aa  256  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  47.59 
 
 		 281 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  49.81 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  48.64 
 
 		 256 aa  248  9e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  47.89 
 
 		 257 aa  248  1e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  47.51 
 
 		 257 aa  246  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  47.51 
 
 		 257 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  43.8 
 
 		 274 aa  241  9e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  43.4 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  45.65 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  50.63 
 
 		 288 aa  235  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  48.19 
 
 		 280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  44.7 
 
 		 266 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  49.15 
 
 		 257 aa  229  5e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.02 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  43.91 
 
 		 270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  43.48 
 
 		 278 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.91 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.91 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  43.54 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  47.9 
 
 		 265 aa  223  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  44.53 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  45.7 
 
 		 262 aa  223  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  45.7 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.17 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  43.17 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  43.17 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  43.17 
 
 		 270 aa  222  6e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  46.31 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  45.49 
 
 		 265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  45.31 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  42.15 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  44.66 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  44.66 
 
 		 258 aa  219  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2126  NLPA lipoprotein  42.54 
 
 		 267 aa  218  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  46.22 
 
 		 258 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  43.12 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  43.12 
 
 		 271 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  44.49 
 
 		 273 aa  216  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  46.22 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  42.38 
 
 		 271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  43.12 
 
 		 271 aa  215  8e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  41.57 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  47.03 
 
 		 264 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  41.57 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  46.64 
 
 		 257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  41.57 
 
 		 270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  42.38 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  42.38 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  42.38 
 
 		 271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  41.57 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  41.95 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  41.2 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  41.2 
 
 		 270 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  46.86 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  41.57 
 
 		 270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  41.57 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  41.57 
 
 		 268 aa  212  7e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  44.81 
 
 		 281 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  44.58 
 
 		 272 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.81 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.81 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  43.7 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.81 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.81 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>