More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16970 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  100 
 
 		 292 aa  577  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  62.21 
 
 		 272 aa  305  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  54.35 
 
 		 278 aa  279  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  54.35 
 
 		 277 aa  271  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  55.89 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  55.12 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  49.83 
 
 		 288 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  52.85 
 
 		 278 aa  245  6.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  47.08 
 
 		 265 aa  238  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 279 aa  235  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  51.05 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  48.11 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  49.4 
 
 		 260 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  52.1 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0933  ABC transport system substrate-binding protein  49.8 
 
 		 285 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  43.48 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  50.21 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  50.21 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  50.42 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  48.46 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  48.39 
 
 		 270 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16980  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  47.18 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0692706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  43.93 
 
 		 281 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  49.37 
 
 		 263 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  48.33 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0807  NLPA lipoprotein  49.6 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  48.33 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  51.05 
 
 		 256 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.13 
 
 		 270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  48.33 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  45.09 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  48.79 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  49.58 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  47.35 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  49.17 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  47.41 
 
 		 264 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  47.15 
 
 		 281 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.15 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.15 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.15 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.15 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.15 
 
 		 272 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  47.15 
 
 		 272 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  47.5 
 
 		 261 aa  218  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  44.04 
 
 		 271 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  46.97 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  44.04 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.75 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  43.77 
 
 		 273 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  44.04 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  44.04 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  44.04 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  44.03 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  44.04 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  46.84 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  45.57 
 
 		 257 aa  215  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  48.52 
 
 		 262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  47.28 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  45.57 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  45.15 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  48.52 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1390  NLPA lipoprotein  48.98 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130276  hitchhiker  0.00486036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  46.31 
 
 		 274 aa  212  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  45.9 
 
 		 274 aa  211  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  47.74 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  47.9 
 
 		 266 aa  209  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  47.48 
 
 		 266 aa  210  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  43.7 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  44.36 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  44 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  45.49 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  45.71 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  46.09 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  45.71 
 
 		 311 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  40.96 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  45.52 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  46.12 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  42.96 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  45.27 
 
 		 258 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  45.87 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  44.81 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  45.87 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  45.87 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  45.87 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  46.41 
 
 		 257 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  45.71 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  45.61 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2335  NLPA lipoprotein  43.61 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  44.9 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  44.9 
 
 		 268 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  49.17 
 
 		 264 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  45.45 
 
 		 268 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  44.26 
 
 		 529 aa  202  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  48.97 
 
 		 264 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  44.24 
 
 		 260 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  42.34 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  48.78 
 
 		 264 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  49.59 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  44.49 
 
 		 268 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  49.59 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>