More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0112 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  100 
 
 		 256 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  99.22 
 
 		 256 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  98.05 
 
 		 256 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  94.92 
 
 		 256 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  85 
 
 		 260 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  83.85 
 
 		 260 aa  427  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  84.82 
 
 		 257 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  78.12 
 
 		 256 aa  378  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  70.54 
 
 		 260 aa  371  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  75.88 
 
 		 257 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  75.1 
 
 		 257 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  68.02 
 
 		 311 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  68.02 
 
 		 261 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  68.02 
 
 		 261 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  67.61 
 
 		 261 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  64.23 
 
 		 260 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  67.21 
 
 		 265 aa  329  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  63.08 
 
 		 260 aa  328  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  69.35 
 
 		 259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  68.95 
 
 		 259 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  65.55 
 
 		 266 aa  316  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  65.4 
 
 		 278 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  63.87 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  61.83 
 
 		 266 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  65.68 
 
 		 264 aa  310  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  63.33 
 
 		 261 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  63.33 
 
 		 261 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  62.5 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  60.5 
 
 		 284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  60.5 
 
 		 284 aa  302  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  59.45 
 
 		 265 aa  297  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  60.58 
 
 		 259 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  58.7 
 
 		 273 aa  281  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  55.89 
 
 		 261 aa  280  2e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  56.07 
 
 		 281 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  57.5 
 
 		 260 aa  272  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  53.94 
 
 		 263 aa  272  3e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  53.31 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  54.72 
 
 		 256 aa  267  8.999999999999999e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  53.31 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  52.92 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  55.25 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  53.17 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  53.39 
 
 		 274 aa  258  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  54.13 
 
 		 277 aa  258  9e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  51.09 
 
 		 278 aa  255  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  55.42 
 
 		 277 aa  254  7e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  51.35 
 
 		 259 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  52.08 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  50.77 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  49.81 
 
 		 259 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  50.97 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  50.38 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  53.1 
 
 		 257 aa  249  5e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  50.4 
 
 		 264 aa  247  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  50.79 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  50.79 
 
 		 258 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  51.15 
 
 		 258 aa  244  9e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  49.62 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  51.19 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  47.94 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  50.42 
 
 		 258 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  47.55 
 
 		 268 aa  240  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.55 
 
 		 268 aa  240  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  47.55 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.31 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.55 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  47.55 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  47.17 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  47.17 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  47.55 
 
 		 268 aa  238  5e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.17 
 
 		 268 aa  238  5e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.57 
 
 		 270 aa  238  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  47.57 
 
 		 270 aa  238  8e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.17 
 
 		 268 aa  238  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  47.57 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.57 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  50 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  47.19 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  47.19 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.57 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  49.38 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  48.52 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  47.19 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  46.9 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  47.55 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  49.4 
 
 		 292 aa  231  6e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  50 
 
 		 265 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  50.83 
 
 		 278 aa  230  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2126  NLPA lipoprotein  49.15 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  47.08 
 
 		 258 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  47.64 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  47.64 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  50.41 
 
 		 281 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.41 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.41 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.41 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.41 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.41 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  47.64 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>