More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1485 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  100 
 
 		 281 aa  559  1e-158  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  56.23 
 
 		 278 aa  292  3e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  58.26 
 
 		 262 aa  289  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  57.85 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  57.85 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  58.68 
 
 		 261 aa  281  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  56.07 
 
 		 256 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  56.07 
 
 		 256 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  56.07 
 
 		 256 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  56.1 
 
 		 260 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  52.13 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  56.72 
 
 		 260 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  56.49 
 
 		 260 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  51.22 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  55.04 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  52.88 
 
 		 277 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  56.07 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  56.05 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  56.07 
 
 		 257 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  57.38 
 
 		 260 aa  262  6e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  50.53 
 
 		 278 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  47.59 
 
 		 284 aa  256  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  47.59 
 
 		 284 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  48.39 
 
 		 257 aa  254  9e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  53.97 
 
 		 263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  53.44 
 
 		 311 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  53.44 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  48.39 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  53.85 
 
 		 261 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  50.19 
 
 		 280 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  52.52 
 
 		 266 aa  252  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  47.67 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  52.63 
 
 		 261 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  48.59 
 
 		 278 aa  247  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  46.48 
 
 		 265 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  54.36 
 
 		 265 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  54.25 
 
 		 257 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  50.81 
 
 		 264 aa  245  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  51.46 
 
 		 266 aa  245  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  51.68 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  44.84 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  51.21 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  46.59 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  53.39 
 
 		 260 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  50.84 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  47.55 
 
 		 271 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  47.55 
 
 		 271 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  50.21 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  51.05 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  50.63 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  50.21 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  52.63 
 
 		 257 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  50 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  50.63 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1131  NLPA lipoprotein  53.09 
 
 		 275 aa  235  8e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  47.9 
 
 		 271 aa  234  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  46.85 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  46.85 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  46.85 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  46.5 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  51.88 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  55.46 
 
 		 257 aa  233  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  49.8 
 
 		 288 aa  232  6e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  47.48 
 
 		 258 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  47.48 
 
 		 258 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  51.19 
 
 		 270 aa  232  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  49.37 
 
 		 266 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  51.85 
 
 		 278 aa  231  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  50.41 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  50.85 
 
 		 260 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  50 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  48.12 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.16 
 
 		 270 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  43.16 
 
 		 270 aa  228  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  48.54 
 
 		 262 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.56 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.56 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  46.89 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.56 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  46.47 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.56 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.56 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.59 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  46.89 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  46.99 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  46.53 
 
 		 529 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  47.72 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  47.48 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  55.08 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  44.21 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.21 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.21 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  44.21 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.21 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  46.64 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>