More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0328 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  100 
 
 
260 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  91.92 
 
 
260 aa  483  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  78.69 
 
 
261 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  78.69 
 
 
311 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  79.1 
 
 
261 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  78.28 
 
 
261 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  79.1 
 
 
265 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  77.91 
 
 
259 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  76.31 
 
 
259 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  67.56 
 
 
260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  67.56 
 
 
260 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  69.33 
 
 
257 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  63.46 
 
 
260 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  66.15 
 
 
257 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  67.23 
 
 
256 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  65.97 
 
 
256 aa  329  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  67.23 
 
 
256 aa  329  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  66.81 
 
 
256 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  66.95 
 
 
256 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  64.23 
 
 
257 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  64.29 
 
 
266 aa  322  3e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  64.85 
 
 
264 aa  322  4e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  59.39 
 
 
284 aa  321  6e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  59.39 
 
 
284 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  63.18 
 
 
266 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  63.87 
 
 
262 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  56.81 
 
 
265 aa  301  8.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  60.55 
 
 
261 aa  298  5e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  58.75 
 
 
259 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  60.92 
 
 
261 aa  290  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  60.92 
 
 
261 aa  290  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  56.43 
 
 
256 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  55.08 
 
 
256 aa  274  8e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  55.69 
 
 
263 aa  267  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  53.61 
 
 
261 aa  265  5e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  54.13 
 
 
260 aa  262  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  57.26 
 
 
278 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  51.98 
 
 
257 aa  256  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  51.98 
 
 
257 aa  255  4e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  51.98 
 
 
257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  53.33 
 
 
273 aa  248  6e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  53.72 
 
 
280 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  52.85 
 
 
277 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  47.08 
 
 
274 aa  242  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  53.08 
 
 
257 aa  241  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  48.51 
 
 
277 aa  241  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.87 
 
 
270 aa  239  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  50.21 
 
 
288 aa  239  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  48.5 
 
 
270 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  48.5 
 
 
270 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.5 
 
 
270 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  48.5 
 
 
265 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.5 
 
 
270 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  48.87 
 
 
270 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  48.12 
 
 
270 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  48.12 
 
 
270 aa  236  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  49.25 
 
 
268 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  48.12 
 
 
270 aa  235  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  53.59 
 
 
278 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.5 
 
 
270 aa  234  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  49.62 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.86 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.62 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  49.25 
 
 
268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  49.25 
 
 
268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.25 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.87 
 
 
268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  48.11 
 
 
268 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  49.8 
 
 
272 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  50.85 
 
 
281 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  45.77 
 
 
259 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  48.86 
 
 
268 aa  229  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  45.38 
 
 
259 aa  228  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  45.76 
 
 
270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  45.76 
 
 
270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  45.76 
 
 
270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.76 
 
 
270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  46.97 
 
 
268 aa  224  8e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  45.56 
 
 
261 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  47.13 
 
 
258 aa  222  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  45.39 
 
 
270 aa  221  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.39 
 
 
270 aa  221  9e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.39 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  48.54 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  46.69 
 
 
258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.54 
 
 
270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  48.73 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  47.29 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  45.77 
 
 
259 aa  219  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  48.02 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  43.46 
 
 
259 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  46.36 
 
 
258 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  46.04 
 
 
262 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  47.62 
 
 
256 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  45.98 
 
 
258 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  43.73 
 
 
264 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  47.58 
 
 
276 aa  215  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  46.04 
 
 
279 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  44.36 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  43.75 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>