More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1073 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  100 
 
 
260 aa  513  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  66.67 
 
 
261 aa  349  3e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  64.1 
 
 
273 aa  342  5e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  68.2 
 
 
257 aa  332  3e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  61.85 
 
 
257 aa  325  4.0000000000000003e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  61.04 
 
 
257 aa  323  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  61.45 
 
 
257 aa  323  2e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  58.2 
 
 
256 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  58.3 
 
 
259 aa  300  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  56.03 
 
 
259 aa  291  5e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  58 
 
 
311 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  58.4 
 
 
261 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  58 
 
 
261 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  60.34 
 
 
256 aa  284  8e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  59.91 
 
 
262 aa  284  9e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  59.91 
 
 
262 aa  284  9e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  57.2 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  55 
 
 
260 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  59.92 
 
 
278 aa  280  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  54.07 
 
 
264 aa  280  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  54.92 
 
 
260 aa  279  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  55.27 
 
 
266 aa  277  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  58.82 
 
 
257 aa  274  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  52.49 
 
 
258 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  58.63 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  58.63 
 
 
259 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  57.81 
 
 
256 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  57.81 
 
 
256 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  57.81 
 
 
256 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  52.67 
 
 
260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  55.46 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  52.67 
 
 
260 aa  268  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  52.88 
 
 
281 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  50 
 
 
265 aa  268  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  57.2 
 
 
256 aa  266  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  50.57 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  50.96 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  54.85 
 
 
256 aa  265  4e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  51.16 
 
 
260 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  55.93 
 
 
261 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  55.93 
 
 
261 aa  265  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  52.56 
 
 
284 aa  265  8e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  52.56 
 
 
284 aa  265  8e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  54.66 
 
 
262 aa  265  8e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  52.35 
 
 
277 aa  263  2e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  54.43 
 
 
256 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  54.43 
 
 
256 aa  262  4e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  52.87 
 
 
261 aa  261  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  51.35 
 
 
263 aa  261  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  49.81 
 
 
258 aa  260  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  52.23 
 
 
280 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  53.7 
 
 
257 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  53.7 
 
 
257 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  53.94 
 
 
265 aa  254  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  50.92 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  52.63 
 
 
276 aa  248  5e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  51.65 
 
 
274 aa  248  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  48.33 
 
 
277 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  48.11 
 
 
271 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  47.15 
 
 
266 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  48.11 
 
 
271 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  48.11 
 
 
271 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  47.71 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  47.73 
 
 
271 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  47.73 
 
 
271 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  47.73 
 
 
271 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  48.51 
 
 
288 aa  238  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  47.86 
 
 
264 aa  238  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  47.33 
 
 
259 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  47.73 
 
 
271 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  51.46 
 
 
258 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  46.21 
 
 
259 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  46.42 
 
 
270 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  48.13 
 
 
259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  45.74 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  49.58 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  47.1 
 
 
258 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  47.1 
 
 
258 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  48.21 
 
 
281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  48.21 
 
 
272 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.21 
 
 
272 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.21 
 
 
272 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  47.51 
 
 
265 aa  232  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.21 
 
 
272 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.21 
 
 
272 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.21 
 
 
272 aa  232  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  49.79 
 
 
278 aa  231  8.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  45.24 
 
 
271 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.83 
 
 
272 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  49.37 
 
 
256 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  45.42 
 
 
270 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  47.1 
 
 
264 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  50 
 
 
278 aa  227  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.31 
 
 
270 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  47.74 
 
 
529 aa  225  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  48.12 
 
 
264 aa  225  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  47.1 
 
 
258 aa  226  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  44.44 
 
 
270 aa  225  7e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.7 
 
 
270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  43.92 
 
 
270 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>