More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2507 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  100 
 
 		 261 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  100 
 
 		 261 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  90.04 
 
 		 261 aa  456  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  85.36 
 
 		 262 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  63.88 
 
 		 260 aa  324  9e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  63.74 
 
 		 260 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  61.15 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  63.33 
 
 		 256 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  62.92 
 
 		 256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  62.92 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  64.34 
 
 		 257 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  62.08 
 
 		 257 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  63.03 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  59.54 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  62.3 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  59.16 
 
 		 260 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  62.3 
 
 		 261 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  63.03 
 
 		 264 aa  298  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  62.3 
 
 		 261 aa  297  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  62.4 
 
 		 265 aa  295  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  61.67 
 
 		 266 aa  295  5e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  60.83 
 
 		 256 aa  295  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  58.92 
 
 		 259 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  60.85 
 
 		 257 aa  294  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  60.66 
 
 		 261 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  58.08 
 
 		 266 aa  291  7e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  57.85 
 
 		 281 aa  285  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  57.14 
 
 		 278 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  56.25 
 
 		 284 aa  278  6e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  56.25 
 
 		 284 aa  278  8e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  52.11 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  51.72 
 
 		 257 aa  268  8e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  54.69 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  51.34 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  59.51 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  53.36 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  59.11 
 
 		 259 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  52.9 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  55.14 
 
 		 273 aa  263  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  51.15 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  50.57 
 
 		 261 aa  258  7e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  55.38 
 
 		 257 aa  254  7e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  52.53 
 
 		 259 aa  253  3e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 277 aa  250  1e-65  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  50.96 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  50.63 
 
 		 288 aa  248  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  50 
 
 		 277 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  50.4 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  50.77 
 
 		 256 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  49.42 
 
 		 266 aa  244  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  48.47 
 
 		 262 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  49.22 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  49.59 
 
 		 274 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  49.63 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  51.79 
 
 		 281 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  48.47 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  49.63 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.79 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  49.04 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.79 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  49.04 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  51.26 
 
 		 264 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  48.46 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.79 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.79 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.79 
 
 		 272 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  49.25 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  49.25 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  49.25 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  50 
 
 		 258 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  52.7 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  51.39 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.79 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.06 
 
 		 270 aa  236  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  49.25 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  50.2 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  51.61 
 
 		 272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  51.25 
 
 		 265 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  47.13 
 
 		 259 aa  234  9e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  48.09 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  50.95 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  50.95 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  46.74 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  48.88 
 
 		 271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  46.36 
 
 		 259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  47.78 
 
 		 268 aa  232  5e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  48.66 
 
 		 258 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  50.84 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  47.92 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  47.89 
 
 		 265 aa  229  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  47.35 
 
 		 271 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  47.27 
 
 		 276 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1131  NLPA lipoprotein  47.71 
 
 		 275 aa  228  8e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  50.78 
 
 		 281 aa  226  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  48.76 
 
 		 262 aa  225  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  46.74 
 
 		 292 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  50.2 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  49.8 
 
 		 266 aa  225  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  52.07 
 
 		 264 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  52.07 
 
 		 264 aa  224  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>