More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5165 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 261 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  98.08 
 
 		 261 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  97.17 
 
 		 311 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  94.64 
 
 		 261 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  80.46 
 
 		 260 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  77.78 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  85.12 
 
 		 259 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  85.54 
 
 		 259 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  81.97 
 
 		 265 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  71.26 
 
 		 260 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  69.73 
 
 		 260 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  71.13 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  68.58 
 
 		 260 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  71.85 
 
 		 257 aa  350  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  71.85 
 
 		 256 aa  346  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  65.15 
 
 		 284 aa  345  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  65.15 
 
 		 284 aa  344  8.999999999999999e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  70.17 
 
 		 256 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  69.75 
 
 		 256 aa  341  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  68.91 
 
 		 266 aa  341  7e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  69.75 
 
 		 256 aa  341  9e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  68.58 
 
 		 257 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  68.64 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  67.43 
 
 		 257 aa  331  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  65.69 
 
 		 266 aa  316  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  64.71 
 
 		 262 aa  315  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  60.4 
 
 		 265 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  61.25 
 
 		 259 aa  298  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  60.92 
 
 		 261 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  60 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  60.92 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  60.92 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  58.26 
 
 		 260 aa  288  7e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  60.68 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  55.13 
 
 		 261 aa  276  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  52.73 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  53.57 
 
 		 257 aa  268  8.999999999999999e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  53.57 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  53.17 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  51.34 
 
 		 263 aa  261  8.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  52.38 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  53.85 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  50.56 
 
 		 277 aa  253  3e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  54.02 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  52.7 
 
 		 288 aa  251  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  52.83 
 
 		 277 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  48.87 
 
 		 265 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  52.07 
 
 		 274 aa  246  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  54.01 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  53.28 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  49.04 
 
 		 259 aa  241  7e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  49.61 
 
 		 256 aa  241  7.999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  49.23 
 
 		 262 aa  241  9e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  49.61 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  49.23 
 
 		 262 aa  240  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  49.24 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.58 
 
 		 270 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  47.96 
 
 		 270 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  51.02 
 
 		 272 aa  231  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  47.21 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  47.21 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  46.84 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  46.84 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.21 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.21 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  44.77 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  46.72 
 
 		 259 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.21 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  46.84 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  47.62 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  47.62 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  47.57 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  45.76 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.76 
 
 		 270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  47.62 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.39 
 
 		 270 aa  224  8e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  45.95 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.39 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  45.39 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  44.65 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  44.65 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  50.42 
 
 		 273 aa  221  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  44.65 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.65 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  48.4 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  44.83 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  46.07 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  46.33 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  46.96 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.44 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  46.44 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.44 
 
 		 268 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.44 
 
 		 268 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  48.95 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  46.44 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  46.07 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0627  NLPA lipoprotein  43.58 
 
 		 264 aa  216  2e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  46.07 
 
 		 268 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  48.97 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  48.83 
 
 		 268 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>