More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0439 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  100 
 
 
272 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  98.16 
 
 
272 aa  532  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  97.79 
 
 
272 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  91.18 
 
 
271 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  97.79 
 
 
272 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  97.79 
 
 
272 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  97.79 
 
 
272 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  91.18 
 
 
271 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  97.79 
 
 
272 aa  501  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  97.79 
 
 
281 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  91.18 
 
 
271 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  90.07 
 
 
271 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  90.07 
 
 
271 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  89.34 
 
 
271 aa  494  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  88.97 
 
 
271 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  79.78 
 
 
270 aa  441  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  81.99 
 
 
270 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  78.68 
 
 
270 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  72.06 
 
 
271 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  72.86 
 
 
270 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  67.28 
 
 
268 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  69.92 
 
 
268 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  69.92 
 
 
268 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  63.94 
 
 
269 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  63.94 
 
 
269 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  63.67 
 
 
266 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  69.92 
 
 
268 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  68.29 
 
 
268 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  62.91 
 
 
297 aa  352  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  68.7 
 
 
268 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  68.7 
 
 
268 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  68.29 
 
 
268 aa  349  2e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  65 
 
 
259 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  65 
 
 
259 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  70.25 
 
 
268 aa  348  7e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  64.62 
 
 
259 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  69.83 
 
 
268 aa  346  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  69.26 
 
 
529 aa  345  3e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  57.35 
 
 
266 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  61.63 
 
 
264 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  59.76 
 
 
272 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  58.82 
 
 
265 aa  298  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  59.93 
 
 
281 aa  298  9e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  55.97 
 
 
286 aa  295  4e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  60.29 
 
 
266 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  60.29 
 
 
266 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  59.5 
 
 
262 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  58.09 
 
 
264 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  58.09 
 
 
266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  58.09 
 
 
266 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  59.93 
 
 
266 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  57.44 
 
 
258 aa  281  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  55.27 
 
 
274 aa  281  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  57.92 
 
 
259 aa  279  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  59.92 
 
 
265 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  53.68 
 
 
258 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  53.68 
 
 
258 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  55.88 
 
 
264 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  59.11 
 
 
265 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  54.41 
 
 
264 aa  275  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  61.03 
 
 
266 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  54.78 
 
 
264 aa  272  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  54.78 
 
 
264 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  54.78 
 
 
264 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  55.15 
 
 
264 aa  271  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0217  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.82 
 
 
264 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2556  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.82 
 
 
264 aa  271  9e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  53.08 
 
 
258 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  58.02 
 
 
265 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2868  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.76 
 
 
266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257161  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  50.74 
 
 
264 aa  268  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2978  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.46 
 
 
266 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  53.91 
 
 
258 aa  267  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  55.97 
 
 
262 aa  267  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  53.49 
 
 
258 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0412  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  61.29 
 
 
259 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0932  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  61.29 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  55.79 
 
 
257 aa  265  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2929  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.82 
 
 
266 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  52.42 
 
 
269 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  53.33 
 
 
257 aa  258  8e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  52.96 
 
 
271 aa  257  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  50.39 
 
 
259 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  54.13 
 
 
257 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  52.96 
 
 
271 aa  256  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.84 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.48 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.84 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.84 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.84 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.84 
 
 
271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  50.81 
 
 
266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.66 
 
 
271 aa  254  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  52.59 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  52.59 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  52.59 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.66 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  56.38 
 
 
260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  52.59 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  52.59 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>