More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1612 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  91.83 
 
 		 257 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  79.84 
 
 		 258 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  78.29 
 
 		 258 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  56.37 
 
 		 259 aa  300  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  60.67 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  57.42 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  55.98 
 
 		 259 aa  298  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  54.83 
 
 		 259 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  59.43 
 
 		 265 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  57.49 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  59.66 
 
 		 265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  58.92 
 
 		 264 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  58.54 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  59.75 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  59.75 
 
 		 264 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  58.33 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  59.34 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  58.4 
 
 		 258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  54.96 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  57.14 
 
 		 281 aa  285  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  54.96 
 
 		 266 aa  285  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  58.82 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  57.98 
 
 		 259 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  54.09 
 
 		 270 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  52.33 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  52.33 
 
 		 258 aa  281  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  54.77 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  53.67 
 
 		 268 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  55.02 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  52.92 
 
 		 270 aa  276  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  54.94 
 
 		 264 aa  274  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  52.33 
 
 		 258 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  53.94 
 
 		 266 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  53.94 
 
 		 266 aa  272  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  53.03 
 
 		 271 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.92 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  55.04 
 
 		 257 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  55.83 
 
 		 266 aa  271  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  56.17 
 
 		 263 aa  271  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  51.91 
 
 		 297 aa  271  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2868  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.75 
 
 		 266 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257161  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  50.38 
 
 		 264 aa  270  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2978  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.75 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  55.12 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  54.51 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  54.51 
 
 		 268 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2556  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.09 
 
 		 264 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0217  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.09 
 
 		 264 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0412  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.09 
 
 		 259 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  54.1 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2929  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.32 
 
 		 266 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0932  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  58.09 
 
 		 259 aa  267  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  53.09 
 
 		 529 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  55.51 
 
 		 271 aa  266  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  53.94 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  56.71 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  54.72 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  53.85 
 
 		 265 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  54.33 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  54.72 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  54.33 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  54.72 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  52.87 
 
 		 268 aa  265  5e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  53.11 
 
 		 268 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  55.04 
 
 		 261 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  50.76 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  50.76 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  52.46 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  52.46 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  53.72 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  52.47 
 
 		 270 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  50.76 
 
 		 266 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  53.28 
 
 		 268 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  50.2 
 
 		 262 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  54.13 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  52.44 
 
 		 259 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  52.44 
 
 		 259 aa  260  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  54.29 
 
 		 281 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  54.29 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  54.29 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  54.29 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  54.29 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  52.44 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  54.29 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  53.88 
 
 		 272 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  53.88 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  51.64 
 
 		 269 aa  253  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  49.05 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  50.63 
 
 		 260 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  49.24 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.24 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  48.85 
 
 		 260 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  47.74 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0778  lipoprotein YaeC  49.37 
 
 		 268 aa  237  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  49.79 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  52.14 
 
 		 260 aa  232  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  48.08 
 
 		 260 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  47.29 
 
 		 260 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  48.54 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>