More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7228 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  100 
 
 		 266 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  80.66 
 
 		 279 aa  418  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  82.43 
 
 		 279 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  64.93 
 
 		 278 aa  358  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  64.18 
 
 		 278 aa  352  2.9999999999999997e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0157  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  63.52 
 
 		 274 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5040  NLPA lipoprotein  59.62 
 
 		 275 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.300245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  52.57 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  51.84 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  51.84 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  51.84 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  51.47 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  51.47 
 
 		 271 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  51.84 
 
 		 271 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.55 
 
 		 270 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0901  YaeC family lipoprotein  66.32 
 
 		 209 aa  261  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0867  NLPA lipoprotein  54.13 
 
 		 270 aa  261  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50.74 
 
 		 268 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  49.45 
 
 		 270 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  50.81 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  50.81 
 
 		 281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.81 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.81 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.81 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.81 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.81 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  53.68 
 
 		 260 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.81 
 
 		 272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  50.19 
 
 		 258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  49.8 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  50.19 
 
 		 258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  50.81 
 
 		 268 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  47.78 
 
 		 271 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  51.14 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1102  D-methionine ABC transporter, periplasmic methionine-binding protein  44.19 
 
 		 272 aa  246  3e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  50.81 
 
 		 268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  50.81 
 
 		 268 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  50.37 
 
 		 268 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  55.11 
 
 		 260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  50.41 
 
 		 268 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  50.41 
 
 		 268 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  46.64 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  47.94 
 
 		 258 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  49.59 
 
 		 264 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  50 
 
 		 268 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  47.39 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  47.39 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  47.39 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  48.4 
 
 		 259 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  48.4 
 
 		 259 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  47.33 
 
 		 266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  50.41 
 
 		 529 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  47.33 
 
 		 266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  47.37 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  48 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  48.06 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  49.59 
 
 		 268 aa  231  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  49.79 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  49.17 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  45.32 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  45.49 
 
 		 264 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3855  DL-methionine transporter subunit  46.43 
 
 		 273 aa  224  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  46.27 
 
 		 264 aa  218  6e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  47.19 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  43.45 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  46.97 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  46.97 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  45.49 
 
 		 262 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  46.97 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  46.97 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  46.97 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  48.48 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  43.14 
 
 		 259 aa  215  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  44.87 
 
 		 271 aa  215  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  45.83 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  45.83 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  45.83 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.45 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  45.83 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  45.83 
 
 		 271 aa  214  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  42.75 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  44.22 
 
 		 269 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  45.49 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  45.45 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  45.61 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  45.45 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  45.45 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  45.49 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  42.97 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  44.68 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  44.94 
 
 		 266 aa  211  7e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  43.93 
 
 		 258 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  44.57 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.35 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.35 
 
 		 271 aa  209  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  42.59 
 
 		 271 aa  208  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  42.59 
 
 		 271 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  44.9 
 
 		 286 aa  208  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  42.59 
 
 		 271 aa  208  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  47.72 
 
 		 266 aa  208  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>