More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5040 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5040  NLPA lipoprotein  100 
 
 
275 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.300245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0157  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  75.91 
 
 
274 aa  431  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619051  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0867  NLPA lipoprotein  65.7 
 
 
270 aa  332  3e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666915  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  59.18 
 
 
279 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  62.7 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  59.58 
 
 
279 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  55.6 
 
 
278 aa  295  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  54.62 
 
 
278 aa  291  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  49.06 
 
 
270 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  51.42 
 
 
268 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.43 
 
 
270 aa  246  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  47.62 
 
 
270 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  47.99 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  52.07 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  52.48 
 
 
268 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  47.62 
 
 
271 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  47.25 
 
 
271 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  47.25 
 
 
271 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  47.25 
 
 
271 aa  240  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  47.25 
 
 
271 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  47.25 
 
 
271 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  47.62 
 
 
271 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  50.83 
 
 
529 aa  239  5e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  47.94 
 
 
270 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  48.98 
 
 
264 aa  236  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  46.52 
 
 
281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  46.52 
 
 
272 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.52 
 
 
272 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.52 
 
 
272 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.52 
 
 
272 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.52 
 
 
272 aa  235  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.52 
 
 
272 aa  235  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  48.41 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  48.41 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  48.41 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  48.41 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  49.8 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  48.41 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  49.8 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  50 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  50.41 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  50.41 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  48.41 
 
 
259 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  46.15 
 
 
272 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  49.39 
 
 
268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  47.62 
 
 
297 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  45.72 
 
 
266 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  48.95 
 
 
260 aa  229  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  47.28 
 
 
258 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  49.59 
 
 
268 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  43.49 
 
 
258 aa  225  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  47.7 
 
 
262 aa  224  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1102  D-methionine ABC transporter, periplasmic methionine-binding protein  42.04 
 
 
272 aa  223  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  43.87 
 
 
258 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  43.87 
 
 
258 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  52.94 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  44 
 
 
274 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0901  YaeC family lipoprotein  55.21 
 
 
209 aa  219  5e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  45.75 
 
 
272 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  45.31 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  43.24 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  46.47 
 
 
262 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3855  DL-methionine transporter subunit  45.74 
 
 
273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  42.42 
 
 
264 aa  211  7.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  44.7 
 
 
281 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  41.7 
 
 
259 aa  208  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  46.72 
 
 
266 aa  207  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  46.72 
 
 
266 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  41.31 
 
 
259 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  45.21 
 
 
265 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  46.56 
 
 
266 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  46.15 
 
 
266 aa  205  7e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  44.54 
 
 
259 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  44.44 
 
 
263 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  46.19 
 
 
263 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  47.28 
 
 
266 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  46.86 
 
 
265 aa  203  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  43.1 
 
 
257 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  48.6 
 
 
246 aa  201  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  47.28 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  46.86 
 
 
264 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  43.67 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  46.86 
 
 
264 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  46.86 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  42.68 
 
 
258 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  43.1 
 
 
257 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  46.47 
 
 
265 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  45.64 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  44.3 
 
 
257 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  43.67 
 
 
260 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  43.93 
 
 
261 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  45.61 
 
 
264 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  41 
 
 
258 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  46.03 
 
 
264 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.03 
 
 
267 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  43.03 
 
 
267 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  44.35 
 
 
260 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  39.5 
 
 
278 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  41.54 
 
 
271 aa  190  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5614  NLPA lipoprotein  42.32 
 
 
270 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.321786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>