More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0157 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0157  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5040  NLPA lipoprotein  75.91 
 
 		 275 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.300245 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0867  NLPA lipoprotein  64.14 
 
 		 270 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  63.52 
 
 		 266 aa  314  8e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  60.66 
 
 		 279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  57.09 
 
 		 278 aa  309  2.9999999999999997e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  61.25 
 
 		 279 aa  309  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  56.55 
 
 		 278 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50.37 
 
 		 268 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  47.99 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  47.99 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  47.99 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.25 
 
 		 270 aa  254  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  47.62 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  46.89 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  47.62 
 
 		 271 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  48.35 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  52.03 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  50.75 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  47.37 
 
 		 270 aa  249  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  50 
 
 		 266 aa  248  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  49.05 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  51.22 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  51.22 
 
 		 268 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  49.21 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  50.81 
 
 		 268 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  48.63 
 
 		 266 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  48.63 
 
 		 269 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  48.63 
 
 		 259 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  48.39 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  48.63 
 
 		 269 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0468  YaeC family lipoprotein  48.63 
 
 		 259 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.79 
 
 		 272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  51.22 
 
 		 268 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  51.22 
 
 		 268 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  48.39 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.39 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.39 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.39 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.39 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.39 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  48.63 
 
 		 259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  48.81 
 
 		 297 aa  242  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  51.48 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  50 
 
 		 268 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  55.91 
 
 		 260 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  50.41 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  50 
 
 		 268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0901  YaeC family lipoprotein  58.55 
 
 		 209 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  49.58 
 
 		 529 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  49.37 
 
 		 262 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  48.35 
 
 		 264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  48.13 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1102  D-methionine ABC transporter, periplasmic methionine-binding protein  41.89 
 
 		 272 aa  227  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  46.03 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  43.54 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  46.03 
 
 		 258 aa  226  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  46.86 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  46.8 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  45.59 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  45.19 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  49.37 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  50.2 
 
 		 265 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  45.82 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  48.56 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  48.56 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  48.56 
 
 		 264 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  48.77 
 
 		 264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  46.89 
 
 		 262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  44.67 
 
 		 286 aa  212  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  48.96 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  46.84 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  46.12 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  46.12 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  48.95 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3855  DL-methionine transporter subunit  46.47 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  48.36 
 
 		 264 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  45.8 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  45.32 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  46.84 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.07 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  47.83 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  41.64 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.64 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  45.45 
 
 		 266 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  43.93 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  45.45 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  42.46 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  42.32 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.07 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  42.32 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.07 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  42.32 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  42.32 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  46.61 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.07 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.07 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  42.32 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  43.07 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  42.32 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>