More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2175 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  99.23 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  85.33 
 
 		 259 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  68.91 
 
 		 258 aa  352  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  63.6 
 
 		 262 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  58.3 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  58.3 
 
 		 258 aa  317  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  62.29 
 
 		 257 aa  315  7e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  59.92 
 
 		 272 aa  311  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  58.46 
 
 		 266 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  56.06 
 
 		 264 aa  311  7.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  59.92 
 
 		 259 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  59.4 
 
 		 264 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  57.14 
 
 		 281 aa  305  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  56.76 
 
 		 258 aa  305  7e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  60.17 
 
 		 260 aa  295  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  55.34 
 
 		 266 aa  294  8e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  55.34 
 
 		 266 aa  294  8e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  56.97 
 
 		 266 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  59.83 
 
 		 264 aa  292  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  58.82 
 
 		 265 aa  292  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  60.58 
 
 		 264 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  60.58 
 
 		 264 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  60.17 
 
 		 264 aa  291  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  57.92 
 
 		 264 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  57.14 
 
 		 264 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  56.57 
 
 		 266 aa  291  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  55.17 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  59.57 
 
 		 263 aa  289  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  59.92 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  55.51 
 
 		 262 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  59.02 
 
 		 265 aa  287  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  56.37 
 
 		 257 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  55.65 
 
 		 266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  53.67 
 
 		 265 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  53.7 
 
 		 258 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  54.83 
 
 		 257 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  62.45 
 
 		 266 aa  279  3e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  53.08 
 
 		 258 aa  278  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2868  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  61.34 
 
 		 266 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.257161  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2978  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  61.34 
 
 		 266 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2929  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  61.44 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0217  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.5 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0932  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.5 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0412  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.5 
 
 		 259 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2556  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  59.5 
 
 		 264 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  50.59 
 
 		 270 aa  263  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  56.89 
 
 		 246 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  48.86 
 
 		 271 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  51.45 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0778  lipoprotein YaeC  50.62 
 
 		 268 aa  258  8e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  48.45 
 
 		 270 aa  258  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  50.19 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  48.09 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  51.04 
 
 		 268 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  51.88 
 
 		 260 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  50 
 
 		 274 aa  255  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  50.19 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  50.21 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  50.21 
 
 		 268 aa  254  9e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  50.41 
 
 		 529 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  52.52 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  50.84 
 
 		 261 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.94 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.94 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.94 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.94 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.94 
 
 		 272 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  48.89 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  48.89 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  48.89 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  52.94 
 
 		 272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.89 
 
 		 270 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  49.62 
 
 		 260 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  52.74 
 
 		 278 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  49.18 
 
 		 268 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  49.38 
 
 		 268 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  49.18 
 
 		 268 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  48.96 
 
 		 268 aa  250  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  46.56 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  49.61 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  48.96 
 
 		 268 aa  250  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.1 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  48.83 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.52 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  48.83 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  48.83 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  48.77 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  48.85 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  48.83 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  47.78 
 
 		 270 aa  248  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1501  D-methionine-binding lipoprotein metQ  45.8 
 
 		 269 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.806114  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  48.52 
 
 		 270 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  45.8 
 
 		 269 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  45.8 
 
 		 266 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  47.66 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  47.66 
 
 		 271 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  51.9 
 
 		 256 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  48.85 
 
 		 260 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0371  YaeC family lipoprotein  47.39 
 
 		 259 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>