More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_13010 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  97.58 
 
 		 259 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  85.54 
 
 		 261 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  84.3 
 
 		 261 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  84.71 
 
 		 261 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  83.88 
 
 		 311 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  77.31 
 
 		 260 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  76.54 
 
 		 260 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  82.79 
 
 		 265 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  69.62 
 
 		 260 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  69.62 
 
 		 260 aa  359  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  73.11 
 
 		 257 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  68.5 
 
 		 260 aa  353  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  71.01 
 
 		 256 aa  347  8e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  71.85 
 
 		 256 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  71.85 
 
 		 256 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  71.43 
 
 		 256 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  68.73 
 
 		 257 aa  343  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  71.61 
 
 		 256 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  62.84 
 
 		 284 aa  343  2e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  66.67 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  62.84 
 
 		 284 aa  341  5e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  68.73 
 
 		 257 aa  341  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  66.39 
 
 		 266 aa  337  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  63.28 
 
 		 265 aa  333  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  64.85 
 
 		 266 aa  315  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  63.33 
 
 		 259 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  61.76 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  58.69 
 
 		 256 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  58.44 
 
 		 260 aa  286  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  60.5 
 
 		 261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  60.08 
 
 		 261 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  60.08 
 
 		 261 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  60.26 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  53.61 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  57.92 
 
 		 273 aa  267  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  52.9 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  52.53 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  52.12 
 
 		 257 aa  263  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  53.12 
 
 		 263 aa  261  6.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  51.74 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  54.83 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  51.32 
 
 		 268 aa  248  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  51.49 
 
 		 270 aa  247  1e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  51.49 
 
 		 270 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  51.49 
 
 		 270 aa  247  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  55.08 
 
 		 281 aa  247  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  51.49 
 
 		 270 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  51.49 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  51.12 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  51.12 
 
 		 270 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  50.21 
 
 		 274 aa  244  6.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  51.87 
 
 		 288 aa  244  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  51.12 
 
 		 270 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  51.12 
 
 		 270 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  48.54 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  50 
 
 		 259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  51.12 
 
 		 270 aa  241  6e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  52.11 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  51.01 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  48.12 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  49.23 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  50.38 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  53.59 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  47.1 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  46.72 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  48.87 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  47.74 
 
 		 268 aa  231  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.12 
 
 		 268 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  48.12 
 
 		 268 aa  230  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 276 aa  230  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.12 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  47.74 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  47.74 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.12 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.74 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  49.38 
 
 		 279 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  45.77 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  49.18 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  48.61 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  45.7 
 
 		 256 aa  225  7e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  45.7 
 
 		 256 aa  224  8e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  45.7 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  48.44 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  52.3 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  48.96 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  48.12 
 
 		 268 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  45.21 
 
 		 261 aa  223  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  48.96 
 
 		 283 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  45.63 
 
 		 264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  44.07 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  44.07 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  44.07 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  44.07 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.07 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  45.98 
 
 		 262 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.07 
 
 		 270 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  48.97 
 
 		 276 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  44.07 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  46.61 
 
 		 256 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>