More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0283 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 257 aa  510  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  93 
 
 		 257 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  76.65 
 
 		 257 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  74.23 
 
 		 260 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  74.23 
 
 		 260 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  73.15 
 
 		 256 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  73.15 
 
 		 256 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  74.32 
 
 		 256 aa  359  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  72.37 
 
 		 256 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  66.67 
 
 		 260 aa  354  7.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  70.17 
 
 		 256 aa  347  9e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  69.42 
 
 		 261 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  69.01 
 
 		 261 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  69.01 
 
 		 311 aa  344  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  65 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  67.62 
 
 		 265 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  67.77 
 
 		 261 aa  338  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  64.23 
 
 		 260 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  69.35 
 
 		 259 aa  333  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  69.76 
 
 		 259 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  65.13 
 
 		 266 aa  321  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  63.79 
 
 		 264 aa  319  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  62.24 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  63.6 
 
 		 266 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  60.67 
 
 		 284 aa  308  8e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  57.09 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  58.66 
 
 		 265 aa  305  5.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  61.25 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  61.25 
 
 		 261 aa  300  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  61.51 
 
 		 259 aa  298  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  59.69 
 
 		 261 aa  295  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  58.75 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  56.42 
 
 		 256 aa  288  8e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  57.81 
 
 		 278 aa  277  9e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  58.51 
 
 		 273 aa  276  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  53.1 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  53.99 
 
 		 261 aa  268  5e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  52.55 
 
 		 263 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  53.1 
 
 		 257 aa  268  8e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  52.71 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  55.56 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  53.1 
 
 		 257 aa  251  6e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  52.63 
 
 		 281 aa  250  2e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  55.27 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  48.56 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  49.28 
 
 		 277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  51 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  49.62 
 
 		 259 aa  241  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  47.74 
 
 		 274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  49.03 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  48.85 
 
 		 259 aa  238  5.999999999999999e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  49.41 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  48.43 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  49.38 
 
 		 262 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  48.22 
 
 		 262 aa  229  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  47.69 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  50.4 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  47.55 
 
 		 271 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  44.98 
 
 		 270 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  49.4 
 
 		 281 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  47.3 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.4 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.4 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.4 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.4 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.4 
 
 		 272 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.6 
 
 		 272 aa  228  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  49.38 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  48.81 
 
 		 265 aa  228  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  48.47 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  48.47 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  48.47 
 
 		 271 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  48.47 
 
 		 271 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  48.47 
 
 		 271 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  46.15 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  48.09 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.19 
 
 		 270 aa  224  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  44.36 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  45.14 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  47.67 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  48.32 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  47.22 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.82 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.04 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  44.53 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  44.57 
 
 		 268 aa  222  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  43.66 
 
 		 270 aa  222  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  48.33 
 
 		 262 aa  222  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.57 
 
 		 268 aa  222  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  43.66 
 
 		 270 aa  221  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.66 
 
 		 270 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.57 
 
 		 268 aa  221  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  44.57 
 
 		 268 aa  221  8e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  44.75 
 
 		 258 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  44.75 
 
 		 258 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  44.19 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.57 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  44.19 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.82 
 
 		 270 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  43.24 
 
 		 266 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>