More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1176 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  97.58 
 
 		 259 aa  454  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  85.12 
 
 		 261 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  83.47 
 
 		 311 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  84.3 
 
 		 261 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  83.06 
 
 		 261 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  78.85 
 
 		 260 aa  411  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  78.08 
 
 		 260 aa  410  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  81.56 
 
 		 265 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  69.23 
 
 		 260 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  69.23 
 
 		 260 aa  358  6e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  72.27 
 
 		 257 aa  357  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  68.9 
 
 		 260 aa  355  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  70.59 
 
 		 256 aa  346  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  71.43 
 
 		 256 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  71.43 
 
 		 256 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  71.01 
 
 		 256 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  63.6 
 
 		 284 aa  343  1e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  67.49 
 
 		 264 aa  343  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  69.11 
 
 		 257 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  63.6 
 
 		 284 aa  342  4e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  71.19 
 
 		 256 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  69.11 
 
 		 257 aa  341  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  67.65 
 
 		 266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  62.89 
 
 		 265 aa  335  5.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  65.27 
 
 		 266 aa  316  2e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  62.92 
 
 		 259 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  61.34 
 
 		 262 aa  296  2e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  59.07 
 
 		 256 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  58.44 
 
 		 260 aa  287  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  60.92 
 
 		 261 aa  284  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  60.5 
 
 		 261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  60.5 
 
 		 261 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  60.68 
 
 		 278 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  53.28 
 
 		 257 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  53.31 
 
 		 256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  53.28 
 
 		 257 aa  269  4e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  52.9 
 
 		 257 aa  265  4e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  54.3 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  52.85 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  57.5 
 
 		 273 aa  265  8e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  55.21 
 
 		 257 aa  255  5e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  50.21 
 
 		 274 aa  245  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  52.49 
 
 		 277 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  54.24 
 
 		 281 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  50.57 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  50.75 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  50.75 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  52.23 
 
 		 280 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  50.75 
 
 		 270 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  48.18 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  51.12 
 
 		 270 aa  242  3.9999999999999997e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  50.75 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  51.87 
 
 		 288 aa  242  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  50.75 
 
 		 270 aa  241  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  50.37 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  50.37 
 
 		 270 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  49.23 
 
 		 258 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  50.37 
 
 		 270 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  48.5 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  54.43 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  49.62 
 
 		 259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  50.37 
 
 		 270 aa  238  9e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  50 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  45.95 
 
 		 259 aa  231  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  47.74 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  45.56 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  48.12 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.12 
 
 		 268 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.12 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  47.74 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  47.74 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  49.59 
 
 		 272 aa  228  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  47.37 
 
 		 268 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  46.09 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  46.09 
 
 		 256 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  49.6 
 
 		 276 aa  227  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  46.09 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.37 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.74 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  48.44 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  44.62 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  44.83 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  48.96 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  48.12 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  48.55 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  48.21 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  44.07 
 
 		 270 aa  221  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  50.21 
 
 		 276 aa  221  8e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  44.07 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  44.07 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  44.07 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.07 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.07 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  46.36 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  47.01 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.7 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  44.07 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  48.55 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.07 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>