More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0888 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 277 aa  553  1e-156  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  57.65 
 
 		 276 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  51.76 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  51.65 
 
 		 260 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  51.65 
 
 		 260 aa  267  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  54.07 
 
 		 273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  50.94 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  54.13 
 
 		 256 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  55.56 
 
 		 260 aa  258  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  54.13 
 
 		 256 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  53.72 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  47.96 
 
 		 260 aa  254  8e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  53.53 
 
 		 256 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  53.69 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  51.22 
 
 		 262 aa  251  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  53.11 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  47.12 
 
 		 276 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  52.28 
 
 		 311 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  52.46 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  52.46 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  52.28 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  52.28 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  51.44 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  49.44 
 
 		 261 aa  243  3e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  48.51 
 
 		 260 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  48.58 
 
 		 277 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  49.38 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  50.41 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  47.93 
 
 		 266 aa  238  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  48.88 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  48.97 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  47.24 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  43.4 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  43.4 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  48.97 
 
 		 257 aa  236  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  49.18 
 
 		 256 aa  235  5.0000000000000005e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  50.81 
 
 		 265 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  48.67 
 
 		 263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  48.46 
 
 		 259 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  49.81 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  47.17 
 
 		 266 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  48.56 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  48.98 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  46.51 
 
 		 280 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.49 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  45.23 
 
 		 288 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  46.49 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.71 
 
 		 268 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  46.13 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  46.13 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.13 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  43.32 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  47.48 
 
 		 257 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  45.76 
 
 		 268 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  45.76 
 
 		 268 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  43.32 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.13 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  42.37 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  42.96 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  44.7 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  48.35 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  44.12 
 
 		 265 aa  219  5e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  46.12 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  44.7 
 
 		 262 aa  218  6e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  44.7 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  45.28 
 
 		 258 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  42.76 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  52.7 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  52.28 
 
 		 259 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  44.91 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  44.91 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  43.54 
 
 		 270 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0856  NLPA lipoprotein  42.18 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000425064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0840  NLPA lipoprotein  42.18 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0121683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  43.06 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  41.39 
 
 		 265 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  43.06 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  45.39 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  41.96 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  43.84 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.17 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  43.06 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  43.06 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  43.06 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  44.26 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  43.06 
 
 		 271 aa  209  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  45.23 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.17 
 
 		 270 aa  208  7e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.17 
 
 		 270 aa  208  8e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  42.44 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.71 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  42.44 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  40.93 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  44.76 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  41.16 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  42.44 
 
 		 270 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  41.99 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  43.17 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  45.04 
 
 		 283 aa  205  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  41.3 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>