More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3159 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  57.75 
 
 		 260 aa  299  4e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  60.08 
 
 		 264 aa  297  9e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  59.92 
 
 		 261 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  57.31 
 
 		 260 aa  292  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  57.31 
 
 		 260 aa  291  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  56.54 
 
 		 260 aa  291  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  59.92 
 
 		 261 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  59.5 
 
 		 311 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  59.92 
 
 		 261 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  59.14 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  55.56 
 
 		 284 aa  290  2e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  56.54 
 
 		 260 aa  289  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  55.17 
 
 		 284 aa  287  1e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  58.4 
 
 		 266 aa  285  5.999999999999999e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  56.97 
 
 		 265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  58.75 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  57.98 
 
 		 256 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  58.75 
 
 		 257 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  58.33 
 
 		 259 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  58.06 
 
 		 259 aa  275  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  58.47 
 
 		 259 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  54.39 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  55.51 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  55.08 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  54.62 
 
 		 256 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  52.26 
 
 		 265 aa  262  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  55.08 
 
 		 256 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  52.94 
 
 		 262 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  52.99 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  51.15 
 
 		 261 aa  242  3.9999999999999997e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  50.84 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  50.84 
 
 		 261 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  48.97 
 
 		 260 aa  231  9e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  49.4 
 
 		 280 aa  228  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  46.39 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  48.96 
 
 		 273 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  50 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  47.46 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  48.31 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  43.08 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  43.12 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  42.41 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  46.89 
 
 		 288 aa  209  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  46.9 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  42.41 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  42.02 
 
 		 257 aa  208  6e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  45.95 
 
 		 259 aa  208  6e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  41.56 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  47.46 
 
 		 281 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  44.14 
 
 		 259 aa  205  5e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  43.98 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  43.72 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0627  NLPA lipoprotein  38.78 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  43.1 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2126  NLPA lipoprotein  38.58 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  45.88 
 
 		 269 aa  192  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  40.15 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  43.39 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  41.96 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  46.96 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  39.24 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  39.77 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  46.56 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  40.38 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  41.49 
 
 		 262 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  43.25 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  41.57 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  41.15 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  43.8 
 
 		 272 aa  186  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  41.18 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  46.15 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  41.37 
 
 		 266 aa  186  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  41.67 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  43.98 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  45 
 
 		 268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  38.04 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  38.04 
 
 		 258 aa  182  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  40.22 
 
 		 279 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  38.43 
 
 		 258 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  38.15 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  38.46 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  38.46 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  38.08 
 
 		 258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  38.55 
 
 		 261 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2335  NLPA lipoprotein  43.08 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.41 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  38.66 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  38.66 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  38.58 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.66 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  38.66 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  42.62 
 
 		 278 aa  178  5.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  40.77 
 
 		 263 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  38.58 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  41.48 
 
 		 263 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.58 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  41.13 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  38.25 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.95 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>