More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1072 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  81.85 
 
 
259 aa  423  1e-117  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  58.23 
 
 
260 aa  286  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  53.26 
 
 
261 aa  279  4e-74  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  52.12 
 
 
257 aa  275  6e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  51.74 
 
 
257 aa  274  9e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  51.74 
 
 
257 aa  274  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  57.79 
 
 
273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  56.3 
 
 
257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  54.36 
 
 
262 aa  254  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  50 
 
 
256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  54.66 
 
 
261 aa  251  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  54.66 
 
 
261 aa  251  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  54.66 
 
 
261 aa  248  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  52.56 
 
 
260 aa  247  1e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  51.05 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  48.46 
 
 
260 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  51.48 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  52.97 
 
 
261 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  48.85 
 
 
260 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  52.97 
 
 
311 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  52.97 
 
 
261 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  51.05 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  51.05 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  52.12 
 
 
261 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  51.88 
 
 
257 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  50.85 
 
 
256 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  50.63 
 
 
281 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  47.29 
 
 
256 aa  234  8e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  46.9 
 
 
262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  47.67 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  46.9 
 
 
262 aa  233  3e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  45.74 
 
 
263 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  45.49 
 
 
259 aa  229  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  45.8 
 
 
258 aa  229  4e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  48.98 
 
 
277 aa  229  5e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  44.71 
 
 
259 aa  228  7e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  48.74 
 
 
256 aa  228  9e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  45.38 
 
 
258 aa  227  1e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  45.1 
 
 
259 aa  227  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  47.11 
 
 
265 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  44.96 
 
 
258 aa  226  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  47.74 
 
 
529 aa  225  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  46.91 
 
 
268 aa  225  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  48.18 
 
 
276 aa  225  7e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  49.79 
 
 
288 aa  224  8e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  47.31 
 
 
260 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  48.74 
 
 
264 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  50.39 
 
 
257 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  46.46 
 
 
256 aa  221  7e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.19 
 
 
270 aa  221  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  45.68 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  47.29 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  47.26 
 
 
256 aa  219  5e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.89 
 
 
268 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  46.86 
 
 
262 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  46.34 
 
 
270 aa  218  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  47.26 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  49.79 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  44.96 
 
 
258 aa  217  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  48.43 
 
 
257 aa  217  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  46.54 
 
 
265 aa  218  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  44.57 
 
 
270 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  47.9 
 
 
266 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  43.8 
 
 
266 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  50 
 
 
259 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  47.03 
 
 
264 aa  216  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  47.7 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  46.89 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  49.58 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  45.34 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  45.19 
 
 
274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  45.23 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  43.56 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  43.36 
 
 
271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  46.53 
 
 
280 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  45.9 
 
 
276 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  48.31 
 
 
277 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  45.15 
 
 
266 aa  209  4e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  44.67 
 
 
268 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  44.67 
 
 
268 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  43.85 
 
 
268 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  43.85 
 
 
268 aa  209  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  46.81 
 
 
278 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  42.53 
 
 
284 aa  207  9e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  45.14 
 
 
257 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  43.7 
 
 
270 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  44.26 
 
 
268 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  42.53 
 
 
284 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  43.85 
 
 
268 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  47.9 
 
 
265 aa  205  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  43.63 
 
 
261 aa  205  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  43.03 
 
 
268 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  46.61 
 
 
256 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1802  D-methionine-binding lipoprotein metQ  42.02 
 
 
259 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  46.5 
 
 
264 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  46.64 
 
 
258 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  48.52 
 
 
274 aa  202  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  42.02 
 
 
269 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  42.26 
 
 
271 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>