More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1542 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 258 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  55.04 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  55.7 
 
 		 278 aa  263  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  54.39 
 
 		 273 aa  259  3e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  51.16 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  51.16 
 
 		 257 aa  253  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  51.16 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  50.76 
 
 		 261 aa  250  1e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  50 
 
 		 256 aa  250  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  51.15 
 
 		 260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  49.81 
 
 		 260 aa  242  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  48.46 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  52.52 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  49.23 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  52.3 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  52.3 
 
 		 256 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  48.85 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  51.88 
 
 		 256 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  50.79 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  50.39 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  50.79 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  50.39 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  50.79 
 
 		 271 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  50.63 
 
 		 256 aa  235  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  49.06 
 
 		 271 aa  235  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  48.26 
 
 		 259 aa  234  8e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  47.67 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  50 
 
 		 271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  51.04 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  50.79 
 
 		 271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  51.88 
 
 		 281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  48.26 
 
 		 266 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  46.59 
 
 		 263 aa  232  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  51.04 
 
 		 261 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.76 
 
 		 270 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  47.71 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  50 
 
 		 270 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  50.62 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  48.54 
 
 		 266 aa  229  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  50.21 
 
 		 257 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  50.62 
 
 		 261 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  45.38 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.45 
 
 		 272 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  51.45 
 
 		 272 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  50 
 
 		 270 aa  226  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  49.79 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  51.87 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  48.95 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  51.04 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  46.39 
 
 		 276 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  48.13 
 
 		 256 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.04 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.04 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.04 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.04 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  47.08 
 
 		 264 aa  225  6e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.04 
 
 		 272 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  47.72 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  47.3 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  51.27 
 
 		 277 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  49.38 
 
 		 262 aa  222  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  49.56 
 
 		 264 aa  221  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  46.69 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  48.18 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  48.47 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  48.35 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  44.66 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  48.95 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  45.63 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  47.69 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  45.63 
 
 		 258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  44.66 
 
 		 284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  47.49 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  48.95 
 
 		 261 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  48.37 
 
 		 265 aa  218  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  46.99 
 
 		 257 aa  218  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  50.19 
 
 		 281 aa  218  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  49.58 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  51.04 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.23 
 
 		 270 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  49.58 
 
 		 278 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  44.66 
 
 		 268 aa  216  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.23 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  51.04 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  48.65 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  47.31 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  44.62 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  46.86 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  45.25 
 
 		 266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  51.11 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  46.67 
 
 		 529 aa  214  9e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  46.49 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  46.49 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  46.49 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  45.42 
 
 		 268 aa  214  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.49 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  47.33 
 
 		 260 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.13 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>