More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_03430 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  100 
 
 		 278 aa  546  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  51.88 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  54.23 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  51.91 
 
 		 292 aa  251  8.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  49.26 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  50.57 
 
 		 277 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  53.78 
 
 		 288 aa  240  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  50.18 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  48.9 
 
 		 260 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  48.19 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  50.63 
 
 		 261 aa  234  8e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  50.39 
 
 		 281 aa  232  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  46.55 
 
 		 265 aa  231  7.000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  48.13 
 
 		 278 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  50.83 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  48.31 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  50.83 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  50.83 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  50 
 
 		 260 aa  228  6e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  50.41 
 
 		 257 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  47.92 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  45.93 
 
 		 263 aa  225  8e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  48.52 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0807  NLPA lipoprotein  49.4 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  41.52 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  47.55 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  45.25 
 
 		 259 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  46.5 
 
 		 262 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  46.31 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  46.31 
 
 		 257 aa  221  8e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  49.37 
 
 		 256 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  45.25 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.79 
 
 		 270 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  46.49 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.79 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  45.9 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  41.16 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  48.95 
 
 		 261 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  49.37 
 
 		 261 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  41.16 
 
 		 268 aa  218  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  49.17 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.58 
 
 		 270 aa  218  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  40.58 
 
 		 270 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  48.95 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  48.95 
 
 		 311 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  40.43 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  40.43 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  40.43 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.79 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  40.07 
 
 		 270 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  46.47 
 
 		 262 aa  216  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  45.83 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  48.13 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  39.49 
 
 		 268 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  41.89 
 
 		 274 aa  211  7.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  38.99 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2762  NLPA lipoprotein  42.56 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  45.63 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  38.63 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  38.63 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  52.3 
 
 		 259 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  40.77 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.63 
 
 		 268 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  38.63 
 
 		 268 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  38.63 
 
 		 268 aa  208  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0856  NLPA lipoprotein  40.3 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000425064  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  44 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  44 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0840  NLPA lipoprotein  40.3 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0121683  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  44.17 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.27 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  44.21 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  44.21 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  46.69 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  43.27 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  44.36 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  45.61 
 
 		 260 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  47.93 
 
 		 257 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  47.92 
 
 		 274 aa  205  8e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  44.21 
 
 		 261 aa  204  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  46.22 
 
 		 266 aa  204  9e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.91 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  42.86 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  51.05 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  45.25 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0491  ABC transporter, substrate-binding protein  40.84 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.345427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  48.76 
 
 		 257 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  47.5 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  46.03 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  47.08 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  47.67 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  47.5 
 
 		 274 aa  202  7e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  38.63 
 
 		 268 aa  201  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  41.79 
 
 		 270 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  44.75 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  44.78 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  44.58 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  43.75 
 
 		 257 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  44.17 
 
 		 262 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  39.29 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>