More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1906 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 280 aa  558  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  71.43 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  64.52 
 
 		 278 aa  362  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  60.23 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  58.11 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  56.43 
 
 		 278 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  54.48 
 
 		 288 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  51.06 
 
 		 265 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  55.6 
 
 		 292 aa  263  3e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  55.83 
 
 		 256 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  49.82 
 
 		 281 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0933  ABC transport system substrate-binding protein  55.6 
 
 		 285 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510052  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  54.07 
 
 		 260 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  54.58 
 
 		 260 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  53.78 
 
 		 256 aa  255  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  54.2 
 
 		 256 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  49.47 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  52.24 
 
 		 260 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  53.78 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  53.78 
 
 		 256 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  53.75 
 
 		 257 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  54.1 
 
 		 311 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  54.1 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  52.03 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  52.08 
 
 		 262 aa  248  6e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  50.74 
 
 		 260 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  49.82 
 
 		 260 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  53.28 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  46.64 
 
 		 265 aa  245  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  51.67 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  50 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  51.67 
 
 		 261 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  52.87 
 
 		 261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  48.57 
 
 		 273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  52.65 
 
 		 272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  47.12 
 
 		 257 aa  242  5e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  52.5 
 
 		 261 aa  241  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  52.23 
 
 		 263 aa  241  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  51.88 
 
 		 266 aa  241  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  51.85 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  54.92 
 
 		 274 aa  240  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  54.92 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  51.41 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  46.07 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  52.05 
 
 		 259 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  46.76 
 
 		 257 aa  238  5.999999999999999e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  54.92 
 
 		 274 aa  238  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  52.05 
 
 		 259 aa  238  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2335  NLPA lipoprotein  53.44 
 
 		 269 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  46.4 
 
 		 257 aa  237  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  51.64 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  52.65 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  51.04 
 
 		 264 aa  235  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  43.57 
 
 		 274 aa  234  8e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  48.19 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1390  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 312 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130276  hitchhiker  0.00486036 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  48.19 
 
 		 284 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  49.39 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  50 
 
 		 266 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  45.82 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  51.39 
 
 		 257 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  51 
 
 		 257 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  52.23 
 
 		 259 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0807  NLPA lipoprotein  47.84 
 
 		 286 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  49.38 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  49.38 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  53.04 
 
 		 265 aa  228  9e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  49.8 
 
 		 269 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  51.01 
 
 		 259 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  53.36 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  48.8 
 
 		 257 aa  224  8e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  48.97 
 
 		 258 aa  224  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  46.64 
 
 		 261 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  48.33 
 
 		 258 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  52.03 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  46.43 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  46.43 
 
 		 266 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  50.4 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  52.65 
 
 		 264 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  50 
 
 		 262 aa  221  8e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  51.67 
 
 		 265 aa  221  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  44.37 
 
 		 271 aa  221  9e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  51.85 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  50.2 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  51.85 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  51.85 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  49.38 
 
 		 278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  48.15 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  48.22 
 
 		 276 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  51.45 
 
 		 264 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  46.4 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  46.4 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  46.4 
 
 		 271 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  46.4 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  46.4 
 
 		 271 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  47.31 
 
 		 265 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  48.76 
 
 		 262 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  45.97 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>