More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1390 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1390  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 312 aa  609  1e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130276  hitchhiker  0.00486036 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0933  ABC transport system substrate-binding protein  64.86 
 
 		 285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0807  NLPA lipoprotein  53.75 
 
 		 286 aa  266  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  45.88 
 
 		 278 aa  245  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  47.35 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  46.82 
 
 		 277 aa  235  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  43.33 
 
 		 265 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  48.12 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  46.95 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  48.08 
 
 		 272 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  48.33 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16980  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  45.21 
 
 		 280 aa  205  7e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0692706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  45.04 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  40.59 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  40.6 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  42.53 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  42.91 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  44.66 
 
 		 278 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  37.99 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  42.39 
 
 		 256 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  41.41 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  41.31 
 
 		 279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  37.92 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  39.46 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  40.91 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  41.08 
 
 		 256 aa  182  6e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  40.33 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  39.67 
 
 		 257 aa  179  7e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  41.32 
 
 		 260 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  40.08 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  39.26 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  40.08 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  41.25 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  38.59 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  39.26 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  38.59 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  40.23 
 
 		 260 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  40.08 
 
 		 273 aa  176  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  39.92 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  38.37 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  35.69 
 
 		 277 aa  172  7.999999999999999e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  41.09 
 
 		 274 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  39.64 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  37.9 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  40.7 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  37.6 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  37.6 
 
 		 261 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  39.76 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  39.13 
 
 		 269 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  37.66 
 
 		 261 aa  167  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  40.7 
 
 		 274 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  37.21 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  34.51 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  38.02 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  36.1 
 
 		 266 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  36.82 
 
 		 259 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2335  NLPA lipoprotein  39.71 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  35.5 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  39.24 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  35.5 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  36.59 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  36.12 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  36.12 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  35.56 
 
 		 271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  36.12 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  36.21 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36.12 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  37.88 
 
 		 259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  34.81 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  34.81 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  37.45 
 
 		 264 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2126  NLPA lipoprotein  38.26 
 
 		 267 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  34.81 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  34.81 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  34.81 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  34.81 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  36.76 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  39.02 
 
 		 257 aa  162  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  35.36 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  35.16 
 
 		 264 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0627  NLPA lipoprotein  34.46 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  37.65 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.36 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  38.91 
 
 		 261 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  38.61 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.05 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  38.91 
 
 		 311 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  37.86 
 
 		 262 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  38.49 
 
 		 261 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  35 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  34.6 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  39.02 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  37.02 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  37.02 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  38.49 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  35.88 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10530  lipoprotein, YaeC family  38.49 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0281158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2302  NLPA lipoprotein  39.64 
 
 		 301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197407  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>