More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16980 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_16980  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  100 
 
 		 280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0692706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  51.38 
 
 		 272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  46.33 
 
 		 292 aa  228  9e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  48.54 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  43.46 
 
 		 277 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  43.89 
 
 		 280 aa  205  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1390  NLPA lipoprotein  45.38 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130276  hitchhiker  0.00486036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  42.97 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  42.07 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  41.85 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  42.23 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0933  ABC transport system substrate-binding protein  43.92 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510052  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  38.58 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  41.11 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  41.34 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0807  NLPA lipoprotein  44.49 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  38.29 
 
 		 276 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  41.34 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  40.85 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  41.37 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  39.92 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2126  NLPA lipoprotein  40.55 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  40.17 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  39.1 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  40.42 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  38.35 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  40.59 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  40.42 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  38.76 
 
 		 259 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  39.18 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40.59 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  39.59 
 
 		 278 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  38.78 
 
 		 274 aa  172  5e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  39.36 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  38.37 
 
 		 259 aa  172  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  39.06 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  37.45 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  36.13 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  38.78 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  39.92 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  38.91 
 
 		 262 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  41.3 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  37.84 
 
 		 268 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  39.33 
 
 		 260 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  39.24 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  37.5 
 
 		 263 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  35.71 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  38.82 
 
 		 279 aa  169  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  39.08 
 
 		 256 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  37.04 
 
 		 272 aa  168  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  40.64 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  35.29 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  38.24 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  38.41 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  36.76 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  37.23 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  37.89 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  37.89 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  35.74 
 
 		 278 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  39.41 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  38.66 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  38.66 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  40.24 
 
 		 261 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  39.08 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  38.7 
 
 		 266 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  38.7 
 
 		 266 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  39.33 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  38.37 
 
 		 258 aa  165  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  37.45 
 
 		 259 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  35.02 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  36.15 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  37.39 
 
 		 259 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  35.8 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  35.79 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  40.25 
 
 		 264 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  38.82 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2369  NLPA lipoprotein  46.55 
 
 		 246 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0617625  normal  0.697334 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  33.98 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  33.98 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  37.08 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  39.32 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  35.42 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.3 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  37.13 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  33.98 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  33.98 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  39.44 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  35.14 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  37.4 
 
 		 273 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  36.84 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  39.83 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  38.33 
 
 		 259 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  35.14 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  36.43 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  35.59 
 
 		 256 aa  159  6e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  37.82 
 
 		 266 aa  158  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2666  NLPA lipoprotein  38.82 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  35.59 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  36.4 
 
 		 261 aa  158  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  36.99 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>