More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1341 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  100 
 
 
269 aa  539  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  83.96 
 
 
268 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  76.11 
 
 
274 aa  384  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  76.52 
 
 
274 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  76.11 
 
 
274 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2335  NLPA lipoprotein  72.51 
 
 
269 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  54.92 
 
 
288 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  48.33 
 
 
277 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  49.8 
 
 
280 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  48.75 
 
 
278 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  49.59 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  49.38 
 
 
278 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  49.8 
 
 
260 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  48.43 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  49.39 
 
 
311 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  43.98 
 
 
257 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  47.49 
 
 
260 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  49.39 
 
 
261 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  49.39 
 
 
261 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  48.99 
 
 
261 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  47.1 
 
 
260 aa  208  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  43.23 
 
 
257 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  43.23 
 
 
257 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  43.61 
 
 
265 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  45.27 
 
 
292 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  47.95 
 
 
262 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  45.15 
 
 
260 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  46.06 
 
 
270 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  44.28 
 
 
271 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  44.36 
 
 
261 aa  201  8e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  46.31 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  44.49 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  46.67 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  44.49 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  45.9 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  43.35 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  43.53 
 
 
256 aa  199  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  44.15 
 
 
263 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.89 
 
 
270 aa  198  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  47.33 
 
 
261 aa  198  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  47.72 
 
 
256 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  47.33 
 
 
261 aa  198  7e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  43.7 
 
 
271 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  43.7 
 
 
271 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  43.7 
 
 
271 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  47.72 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  47.72 
 
 
256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  43.31 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  46.75 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  41.01 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  45.45 
 
 
259 aa  195  7e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  46.18 
 
 
264 aa  195  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  44.94 
 
 
283 aa  194  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  45.12 
 
 
273 aa  194  9e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  43.51 
 
 
270 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  47.28 
 
 
256 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  47.95 
 
 
257 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  44.4 
 
 
260 aa  193  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.35 
 
 
272 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.35 
 
 
272 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.35 
 
 
272 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.35 
 
 
272 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.35 
 
 
272 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  44.35 
 
 
272 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  44.35 
 
 
281 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  44.65 
 
 
266 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  44.75 
 
 
259 aa  192  6e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  44.28 
 
 
266 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  43.49 
 
 
266 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  43.55 
 
 
272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  44.4 
 
 
281 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  43.02 
 
 
264 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  44.86 
 
 
256 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  43.51 
 
 
270 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  47.06 
 
 
257 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  45.42 
 
 
259 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  46.12 
 
 
259 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  43.21 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  43.75 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  46.27 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  46.22 
 
 
265 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1395  NLPA lipoprotein  41.42 
 
 
273 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  40.55 
 
 
261 aa  183  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  41.57 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0933  ABC transport system substrate-binding protein  42.23 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510052  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  45.12 
 
 
256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  44.62 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  41.43 
 
 
262 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  40.23 
 
 
284 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  39.85 
 
 
284 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  41.13 
 
 
529 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  43.43 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  41.13 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  41.92 
 
 
259 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  40.89 
 
 
270 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  38.78 
 
 
256 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  40.89 
 
 
270 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  42.64 
 
 
258 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  42.64 
 
 
258 aa  178  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  38.4 
 
 
262 aa  178  8e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>