More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1395 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1395  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 273 aa  548  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0859  NLPA lipoprotein  86.08 
 
 		 273 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1773  NLPA lipoprotein  82.66 
 
 		 270 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861841 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  60.78 
 
 		 279 aa  337  9e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  67.21 
 
 		 283 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  60.29 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  60.44 
 
 		 268 aa  322  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  60.07 
 
 		 268 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  60.07 
 
 		 268 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  60.07 
 
 		 268 aa  321  9.000000000000001e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  60.07 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  61.57 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  59.71 
 
 		 268 aa  319  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  59.34 
 
 		 268 aa  318  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  58.82 
 
 		 270 aa  318  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  59.19 
 
 		 270 aa  318  5e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  58.82 
 
 		 270 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  58.46 
 
 		 270 aa  316  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  58.46 
 
 		 270 aa  316  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  58.46 
 
 		 270 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  58.46 
 
 		 270 aa  315  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  56.78 
 
 		 268 aa  314  8e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  57.72 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  57.72 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  57.72 
 
 		 270 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  60.07 
 
 		 268 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0840  NLPA lipoprotein  50.37 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0121683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0856  NLPA lipoprotein  50.37 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000425064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0491  ABC transporter, substrate-binding protein  49.06 
 
 		 270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.345427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  46.13 
 
 		 263 aa  218  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  44.94 
 
 		 278 aa  209  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  42.38 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  42.75 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  43.45 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  43.38 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  44.18 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  44.74 
 
 		 257 aa  198  9e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  45.12 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  44.36 
 
 		 257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  43.49 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  46.5 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  42.59 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  43.61 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  44.44 
 
 		 257 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  43.87 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  39.05 
 
 		 268 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  41.8 
 
 		 266 aa  191  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  42.8 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  40.22 
 
 		 271 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  40.58 
 
 		 271 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  40.58 
 
 		 271 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  40.22 
 
 		 271 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  40.58 
 
 		 271 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  42.39 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  39.13 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  40.59 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  42.39 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  43.12 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  42.75 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  44.44 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  42.75 
 
 		 261 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.77 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  39.37 
 
 		 281 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  42.39 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  41.9 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  42.01 
 
 		 261 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  44.03 
 
 		 261 aa  186  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  44.03 
 
 		 261 aa  186  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.9 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.9 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.9 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.9 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  43.03 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.9 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  43.27 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  42.75 
 
 		 311 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  39.92 
 
 		 256 aa  185  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  39.49 
 
 		 271 aa  185  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  39.08 
 
 		 277 aa  184  9e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  39.13 
 
 		 271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  41.5 
 
 		 272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  42.65 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  41.42 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.5 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  38.77 
 
 		 270 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  42.45 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  42.28 
 
 		 266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  38.89 
 
 		 260 aa  182  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  38.78 
 
 		 279 aa  181  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  43.25 
 
 		 274 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  41.98 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  37.45 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  39.92 
 
 		 257 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  41.7 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  40.23 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  38.72 
 
 		 259 aa  179  5.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  45 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  42.86 
 
 		 274 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  39.62 
 
 		 258 aa  178  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  37.5 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>