More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5216 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  100 
 
 		 260 aa  517  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  91.92 
 
 		 260 aa  483  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  80.74 
 
 		 261 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  80.33 
 
 		 261 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  79.92 
 
 		 311 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  79.92 
 
 		 265 aa  387  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  77.87 
 
 		 261 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  80.99 
 
 		 259 aa  374  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  79.34 
 
 		 259 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  66.54 
 
 		 260 aa  352  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  65.77 
 
 		 260 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  69.75 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  64.23 
 
 		 260 aa  347  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  67.23 
 
 		 256 aa  335  5e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  67.31 
 
 		 257 aa  334  7e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  66.53 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  65 
 
 		 257 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  65.97 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  65.97 
 
 		 256 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  65.97 
 
 		 256 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  66.1 
 
 		 256 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  59 
 
 		 284 aa  318  5e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  63.45 
 
 		 266 aa  318  6e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  65.27 
 
 		 266 aa  318  7e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  59 
 
 		 284 aa  317  2e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  63.03 
 
 		 262 aa  305  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  57.2 
 
 		 265 aa  300  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  60 
 
 		 259 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  60.16 
 
 		 261 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  60.92 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  60.92 
 
 		 261 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  57.26 
 
 		 256 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  54.3 
 
 		 256 aa  271  6e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  59.83 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  55.17 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  54.37 
 
 		 261 aa  262  3e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  54.13 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  52.78 
 
 		 257 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  52.78 
 
 		 257 aa  257  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  52.78 
 
 		 257 aa  255  4e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  53.33 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  53.72 
 
 		 280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  51.5 
 
 		 277 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  53.1 
 
 		 257 aa  243  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  50.83 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  51.04 
 
 		 288 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  53.39 
 
 		 281 aa  238  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.25 
 
 		 270 aa  238  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  48.88 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  48.87 
 
 		 270 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  48.87 
 
 		 270 aa  236  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.87 
 
 		 270 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  48.12 
 
 		 265 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.87 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  49.25 
 
 		 270 aa  235  6e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  48.5 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  48.5 
 
 		 270 aa  234  9e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  48.5 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.87 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  48.69 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  50.61 
 
 		 272 aa  231  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.06 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  49.06 
 
 		 268 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  48.11 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  48.69 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  48.69 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  52.74 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.3 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  52.12 
 
 		 273 aa  228  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  48.31 
 
 		 268 aa  228  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  48.31 
 
 		 268 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  49.06 
 
 		 268 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  46.15 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  44.44 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  44.44 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  44.44 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.44 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.81 
 
 		 270 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  47.31 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  47.35 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.81 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  47.69 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  45.77 
 
 		 259 aa  223  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  47.69 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  47.31 
 
 		 258 aa  222  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  46.92 
 
 		 259 aa  222  4e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  47.69 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  47.69 
 
 		 262 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  44.07 
 
 		 270 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0529  NLPA family lipoprotein  47.66 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  46.24 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  47.06 
 
 		 270 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  47.06 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  45.7 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  45.7 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  44.87 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  45.7 
 
 		 256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  43.32 
 
 		 278 aa  215  5.9999999999999996e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  46.06 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  47.33 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>