More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3526 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  100 
 
 
264 aa  526  1e-149  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  86.44 
 
 
266 aa  414  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  71.48 
 
 
284 aa  385  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  71.48 
 
 
284 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  71.97 
 
 
261 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  71.97 
 
 
311 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  71.13 
 
 
261 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  69.87 
 
 
261 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  64.77 
 
 
260 aa  340  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  62.88 
 
 
260 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  66.8 
 
 
265 aa  331  8e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  62.12 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  67.65 
 
 
256 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  64.59 
 
 
260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  63.64 
 
 
260 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  67.49 
 
 
259 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  66.67 
 
 
259 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  65.97 
 
 
257 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  66.1 
 
 
256 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  60 
 
 
265 aa  314  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  65.68 
 
 
256 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  65.68 
 
 
256 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  65.68 
 
 
256 aa  310  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  64.29 
 
 
262 aa  307  9e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  62.5 
 
 
257 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  62.12 
 
 
257 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  63.03 
 
 
261 aa  298  8e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  63.03 
 
 
261 aa  298  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  60.17 
 
 
256 aa  295  4e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  60 
 
 
259 aa  293  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  60.5 
 
 
261 aa  289  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  59.24 
 
 
266 aa  288  8e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  55.65 
 
 
260 aa  280  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  54.79 
 
 
278 aa  277  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  49.45 
 
 
273 aa  268  8.999999999999999e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  51.14 
 
 
261 aa  261  8e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  48.91 
 
 
274 aa  258  9e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  49.81 
 
 
256 aa  251  7e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  48.83 
 
 
257 aa  249  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  48.52 
 
 
281 aa  249  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  49.06 
 
 
263 aa  247  1e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  48.83 
 
 
257 aa  247  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  51.52 
 
 
257 aa  246  2e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  48.44 
 
 
257 aa  244  8e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  46.74 
 
 
277 aa  241  7.999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  52.92 
 
 
288 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  45.56 
 
 
270 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  44.07 
 
 
270 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  49.43 
 
 
280 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.19 
 
 
270 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.19 
 
 
270 aa  236  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.44 
 
 
270 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  48.5 
 
 
277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  45.32 
 
 
270 aa  235  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  45.32 
 
 
270 aa  235  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.32 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.32 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.94 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  44.07 
 
 
270 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  44.07 
 
 
270 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  44.07 
 
 
270 aa  233  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.07 
 
 
270 aa  233  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  44.57 
 
 
270 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  44.94 
 
 
270 aa  232  5e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  44.57 
 
 
270 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  44.57 
 
 
270 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.19 
 
 
270 aa  232  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2126  NLPA lipoprotein  45.56 
 
 
267 aa  231  8.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  46.01 
 
 
264 aa  229  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  48.46 
 
 
259 aa  228  6e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  45.32 
 
 
268 aa  228  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  46.39 
 
 
266 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  46.97 
 
 
259 aa  227  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  51.05 
 
 
258 aa  226  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  45.91 
 
 
258 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  47.6 
 
 
271 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  46.39 
 
 
266 aa  226  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  47.57 
 
 
278 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  44.96 
 
 
279 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2432  hypothetical protein  44.77 
 
 
278 aa  226  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00474668  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  46.92 
 
 
258 aa  224  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  46.92 
 
 
258 aa  224  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0859  NLPA lipoprotein  44.65 
 
 
273 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  46.49 
 
 
271 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  46.49 
 
 
271 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  46.49 
 
 
271 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  46.49 
 
 
271 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  46.49 
 
 
271 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  46.1 
 
 
265 aa  223  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  43.82 
 
 
268 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.82 
 
 
268 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  47.52 
 
 
268 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1215  NLPA family lipoprotein  45.63 
 
 
262 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.624565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  43.82 
 
 
268 aa  223  3e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  43.61 
 
 
266 aa  222  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  47.11 
 
 
268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  43.82 
 
 
268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.82 
 
 
268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1334  NLPA family lipoprotein  45.63 
 
 
262 aa  222  6e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.650743  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  50 
 
 
281 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>