More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0859 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0859  NLPA lipoprotein  100 
 
 
273 aa  547  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1395  NLPA lipoprotein  86.08 
 
 
273 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1773  NLPA lipoprotein  82.29 
 
 
270 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861841 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  69.39 
 
 
279 aa  348  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  69.67 
 
 
283 aa  341  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  61.85 
 
 
268 aa  330  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  62.73 
 
 
268 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  62.36 
 
 
268 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  62.36 
 
 
268 aa  329  3e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  62.36 
 
 
268 aa  329  3e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  60.81 
 
 
270 aa  328  4e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  60.44 
 
 
270 aa  328  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  60.44 
 
 
270 aa  328  7e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  62.36 
 
 
268 aa  328  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  60.44 
 
 
270 aa  327  9e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  61.99 
 
 
268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  61.54 
 
 
268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  61.62 
 
 
268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  60.07 
 
 
270 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  60.07 
 
 
270 aa  325  5e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  60.07 
 
 
270 aa  325  5e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  59.34 
 
 
270 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  59.34 
 
 
270 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  59.71 
 
 
270 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  58.89 
 
 
268 aa  322  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  61.99 
 
 
268 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0856  NLPA lipoprotein  50.75 
 
 
273 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000425064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0840  NLPA lipoprotein  50.75 
 
 
273 aa  263  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0121683  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0491  ABC transporter, substrate-binding protein  49.63 
 
 
270 aa  253  2.0000000000000002e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.345427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  47.62 
 
 
263 aa  228  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  49 
 
 
278 aa  228  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  43.87 
 
 
260 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  43.49 
 
 
260 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  46.12 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  45.93 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  45.78 
 
 
274 aa  211  9e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  44.44 
 
 
260 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  48.15 
 
 
273 aa  208  9e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  45.53 
 
 
262 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  44.85 
 
 
261 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  43.62 
 
 
256 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  46.72 
 
 
260 aa  204  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  44.24 
 
 
257 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  45 
 
 
257 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  41.51 
 
 
256 aa  203  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  43.85 
 
 
257 aa  203  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  44.23 
 
 
257 aa  201  8e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  41.98 
 
 
266 aa  201  9e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  43.21 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  43.21 
 
 
256 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  43.21 
 
 
256 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  44.58 
 
 
311 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  44.58 
 
 
261 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  40.58 
 
 
271 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  44.18 
 
 
261 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  42.8 
 
 
256 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  40.58 
 
 
271 aa  198  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  40.94 
 
 
271 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  40.94 
 
 
271 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  40.94 
 
 
271 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  40.22 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  40.94 
 
 
271 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  43.49 
 
 
257 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  41.46 
 
 
257 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  44.49 
 
 
265 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.22 
 
 
270 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  42.65 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  42.91 
 
 
281 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  43.78 
 
 
261 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  43.62 
 
 
261 aa  194  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.91 
 
 
272 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.91 
 
 
272 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.91 
 
 
272 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  41.15 
 
 
261 aa  194  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.91 
 
 
272 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  43.62 
 
 
261 aa  194  1e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.91 
 
 
272 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  42.96 
 
 
261 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  39.86 
 
 
270 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  42.52 
 
 
272 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  39.13 
 
 
271 aa  192  5e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.52 
 
 
272 aa  192  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  43.15 
 
 
262 aa  192  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  39.78 
 
 
260 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  39.27 
 
 
279 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  39.33 
 
 
266 aa  190  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  41.73 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  43.57 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  44.31 
 
 
259 aa  188  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  38.49 
 
 
268 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  39.47 
 
 
265 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0627  NLPA lipoprotein  40.44 
 
 
264 aa  186  4e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  39.93 
 
 
276 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  38.64 
 
 
258 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  43.14 
 
 
259 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  44.14 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  40.6 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  41.87 
 
 
288 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  38.83 
 
 
284 aa  183  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40 
 
 
258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>