More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0067 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  100 
 
 
257 aa  510  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  80.77 
 
 
260 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  80.77 
 
 
260 aa  417  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  84.82 
 
 
256 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  84.44 
 
 
256 aa  410  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  84.82 
 
 
256 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  85.17 
 
 
256 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  77.82 
 
 
257 aa  394  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  76.65 
 
 
257 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  73.64 
 
 
260 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  76.89 
 
 
256 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  68.08 
 
 
260 aa  359  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  68.46 
 
 
260 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  71.49 
 
 
261 aa  352  4e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  71.07 
 
 
311 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  71.07 
 
 
261 aa  351  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  69.96 
 
 
265 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  70.25 
 
 
261 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  71.77 
 
 
259 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  70.97 
 
 
259 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  66.53 
 
 
266 aa  328  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  65.97 
 
 
266 aa  325  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  65.02 
 
 
264 aa  318  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  63.49 
 
 
262 aa  316  2e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  57.47 
 
 
284 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  57.47 
 
 
284 aa  312  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  61.81 
 
 
265 aa  307  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  62.08 
 
 
261 aa  305  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  62.08 
 
 
261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  62.08 
 
 
261 aa  303  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  62.76 
 
 
259 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  62.45 
 
 
278 aa  298  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  59.14 
 
 
256 aa  292  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  59.66 
 
 
273 aa  277  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  58.82 
 
 
260 aa  275  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  54.75 
 
 
261 aa  271  6e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  52.96 
 
 
256 aa  271  8.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  55.47 
 
 
281 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  51.97 
 
 
263 aa  265  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  51.36 
 
 
257 aa  264  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  51.36 
 
 
257 aa  262  3e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  51.36 
 
 
257 aa  262  3e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  55.81 
 
 
257 aa  260  1e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  51.87 
 
 
277 aa  258  7e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  51.03 
 
 
274 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  51.75 
 
 
259 aa  255  4e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  52.59 
 
 
280 aa  252  5.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  55.6 
 
 
277 aa  251  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  54.85 
 
 
278 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  51.13 
 
 
265 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  50.38 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  50.38 
 
 
259 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  51.05 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  47.49 
 
 
259 aa  239  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  50 
 
 
259 aa  240  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  50 
 
 
272 aa  237  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  48.46 
 
 
258 aa  236  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  49.17 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  48.22 
 
 
276 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  45.66 
 
 
268 aa  233  3e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  46.43 
 
 
264 aa  232  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  44.53 
 
 
268 aa  231  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.53 
 
 
268 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  44.53 
 
 
268 aa  231  8.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1242  NLPA family lipoprotein  47.08 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.324442  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.53 
 
 
268 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2126  NLPA lipoprotein  46.89 
 
 
267 aa  231  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  48.52 
 
 
261 aa  229  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  44.53 
 
 
268 aa  229  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  44.15 
 
 
268 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  46.07 
 
 
270 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  44.15 
 
 
268 aa  229  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  49.38 
 
 
281 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  48.5 
 
 
271 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.38 
 
 
272 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.38 
 
 
272 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  48.06 
 
 
258 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.38 
 
 
272 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.38 
 
 
272 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  48.5 
 
 
271 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.53 
 
 
268 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  48.5 
 
 
271 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.38 
 
 
272 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  50.42 
 
 
262 aa  229  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  50.41 
 
 
278 aa  228  6e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0861  NLPA family lipoprotein  46.69 
 
 
258 aa  228  7e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.945929  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  47.74 
 
 
271 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  48.97 
 
 
272 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  47.74 
 
 
271 aa  228  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0791  NLPA family lipoprotein  46.69 
 
 
258 aa  228  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.027516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  48.5 
 
 
271 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  44.15 
 
 
268 aa  227  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  46.07 
 
 
270 aa  227  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  45.74 
 
 
258 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  45.32 
 
 
270 aa  226  3e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  47.74 
 
 
271 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  47.08 
 
 
258 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  47.08 
 
 
258 aa  225  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  45.32 
 
 
270 aa  224  7e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  45.32 
 
 
270 aa  224  7e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>