More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0648 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 273 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  60.54 
 
 		 280 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  59.54 
 
 		 277 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  59.25 
 
 		 278 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  58.82 
 
 		 272 aa  292  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  55.29 
 
 		 292 aa  262  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  54.01 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  52.11 
 
 		 265 aa  252  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  49.61 
 
 		 263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0933  ABC transport system substrate-binding protein  50.99 
 
 		 285 aa  239  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  47.91 
 
 		 278 aa  235  6e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  49.24 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  44.85 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2335  NLPA lipoprotein  50.41 
 
 		 269 aa  228  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  50.62 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  46.43 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  50.21 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  48.31 
 
 		 257 aa  225  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  48.31 
 
 		 281 aa  225  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  48.52 
 
 		 278 aa  224  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  48.31 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  44.57 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  49.79 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  48.31 
 
 		 257 aa  223  3e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  46.21 
 
 		 260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  51.04 
 
 		 268 aa  222  7e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  46.99 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  50.42 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  50 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  49.58 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  49.58 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  47.37 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  45.22 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  51.05 
 
 		 262 aa  218  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  49.58 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  42.65 
 
 		 279 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  43.17 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  43.17 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  46.93 
 
 		 269 aa  218  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  47.88 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.99 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1390  NLPA lipoprotein  48.35 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130276  hitchhiker  0.00486036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  46.99 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  46.99 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  46.99 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  46.99 
 
 		 271 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  46.99 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  47.06 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  47.45 
 
 		 260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  47.37 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  48.73 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  49.6 
 
 		 270 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  48.73 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  48.25 
 
 		 276 aa  214  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  47.74 
 
 		 270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  50.21 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  47.35 
 
 		 264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  45.35 
 
 		 282 aa  211  7e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  48.31 
 
 		 259 aa  211  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  47.88 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  51.06 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  49.16 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  49.79 
 
 		 272 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  49.16 
 
 		 281 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  50 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.16 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.16 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.16 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.16 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  49.16 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  46.77 
 
 		 259 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  46.77 
 
 		 259 aa  209  5e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  48.74 
 
 		 272 aa  208  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  46.42 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0807  NLPA lipoprotein  43.87 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  44.81 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  46.89 
 
 		 271 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  47.72 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  44.4 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  42.69 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  45.68 
 
 		 259 aa  206  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  47.37 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  46.22 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  49.58 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  43.17 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  43.66 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2762  NLPA lipoprotein  45.32 
 
 		 280 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16980  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  42.97 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0692706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  47.03 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  42.8 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  43.17 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  47.88 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  42.8 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.17 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.54 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  43.17 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  45.68 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  46.41 
 
 		 266 aa  201  7e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>