More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2810 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 272 aa  530  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  62.16 
 
 		 292 aa  306  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  55.8 
 
 		 277 aa  298  8e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  64.02 
 
 		 288 aa  294  9e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  58.17 
 
 		 280 aa  293  3e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  58.66 
 
 		 273 aa  291  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  53.11 
 
 		 278 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  56.02 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  49.08 
 
 		 265 aa  256  3e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0807  NLPA lipoprotein  56.28 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  50.19 
 
 		 278 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  51.32 
 
 		 260 aa  244  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  50.36 
 
 		 279 aa  244  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  49.81 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16980  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  51.21 
 
 		 280 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0692706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  51.57 
 
 		 276 aa  238  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  49.26 
 
 		 264 aa  238  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  44.03 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  49.79 
 
 		 257 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  50.41 
 
 		 260 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  51.02 
 
 		 311 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  48.33 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  49.58 
 
 		 260 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  51.02 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  47.92 
 
 		 257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  48.08 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  45.04 
 
 		 281 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  51.02 
 
 		 261 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  49.16 
 
 		 256 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  52.05 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  50.61 
 
 		 260 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  48.74 
 
 		 256 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  47.92 
 
 		 257 aa  231  1e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  49.16 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  48.74 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  47.74 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  44.29 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  48.76 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  51.64 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  46.9 
 
 		 261 aa  229  4e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  45.87 
 
 		 256 aa  228  6e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  47.37 
 
 		 259 aa  228  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  49.17 
 
 		 261 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  51.23 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0933  ABC transport system substrate-binding protein  52.28 
 
 		 285 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510052  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  49.79 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  47.74 
 
 		 262 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  49.39 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1341  NLPA lipoprotein  48.73 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143755  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  45.28 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  51.44 
 
 		 268 aa  225  6e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  49.15 
 
 		 273 aa  225  7e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  42.03 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  48.33 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  48.33 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  45.42 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  49.38 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  48.33 
 
 		 261 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2335  NLPA lipoprotein  48.86 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209584 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  46.51 
 
 		 263 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  47.95 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  48.55 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  47.15 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  46.69 
 
 		 265 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  43.01 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  42.29 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  42.29 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  42.29 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  42.29 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  42.29 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  42.29 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  44.78 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  45.28 
 
 		 258 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  47.72 
 
 		 259 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  44.72 
 
 		 281 aa  218  6e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.72 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.72 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.72 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.72 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.72 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  45.1 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  43.32 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  44.4 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  44.31 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  43.77 
 
 		 258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  43.77 
 
 		 258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  48.16 
 
 		 265 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  46.89 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  43.32 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  47.92 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  45.09 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  48.06 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  44.31 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  44.02 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  44.02 
 
 		 284 aa  211  7e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  49.59 
 
 		 259 aa  211  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  47.67 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  46.67 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  47.35 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1390  NLPA lipoprotein  49.58 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130276  hitchhiker  0.00486036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>