More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0807 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0807  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 286 aa  566  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0933  ABC transport system substrate-binding protein  57.03 
 
 		 285 aa  279  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1390  NLPA lipoprotein  53.82 
 
 		 312 aa  271  9e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130276  hitchhiker  0.00486036 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  54.37 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  47.31 
 
 		 277 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  45.09 
 
 		 278 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  48.48 
 
 		 280 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  50.58 
 
 		 292 aa  238  8e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  43.87 
 
 		 265 aa  227  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  50.2 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  45.08 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  48.12 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  45.8 
 
 		 273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  49.16 
 
 		 288 aa  212  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  39.92 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  44.77 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  43.46 
 
 		 259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  44.3 
 
 		 257 aa  195  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  43.27 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  42.8 
 
 		 262 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  43.88 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  43.04 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  43.88 
 
 		 256 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  43.88 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  43.88 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  44.73 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  43.88 
 
 		 256 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  43.88 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16980  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  44.44 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0692706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  44.3 
 
 		 256 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  38.41 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  43.88 
 
 		 266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  40 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  42.74 
 
 		 265 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  40.88 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  39.27 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  39.27 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  41.32 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  41.77 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  42.15 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  41.32 
 
 		 261 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  41.42 
 
 		 281 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  42.04 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  40.85 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  41.77 
 
 		 261 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1449  NLPA lipoprotein  41.35 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3159  NLPA lipoprotein  43.88 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  41.35 
 
 		 311 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  41.76 
 
 		 257 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  40.08 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  40.08 
 
 		 257 aa  178  1e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  40.08 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  43.46 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  40.51 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  38.66 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  39.66 
 
 		 257 aa  175  9e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  40.31 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  42.62 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2762  NLPA lipoprotein  37.73 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  41.56 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  41.56 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  39.46 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  40.38 
 
 		 282 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  39.92 
 
 		 259 aa  172  5.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3279  NLPA lipoprotein  35.54 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  39.24 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  41.56 
 
 		 258 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  39.54 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2743  NLPA lipoprotein  39.75 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  39.62 
 
 		 264 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2662  NLPA family lipoprotein  39.34 
 
 		 274 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  37.1 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  37.1 
 
 		 271 aa  168  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  38.18 
 
 		 266 aa  168  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  37.1 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  37.55 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  40.17 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  37.55 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  36.75 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  36.75 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  36.75 
 
 		 271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  39.52 
 
 		 270 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1546  NLPA family lipoprotein  38.93 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  40.76 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.53 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  39.34 
 
 		 271 aa  165  9e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  35.16 
 
 		 270 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  35.53 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  39.17 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.53 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  37.13 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  39.75 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  35.53 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  35.53 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2631  NLPA lipoprotein  39.92 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  35.53 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.16 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  40 
 
 		 262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.92 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.8 
 
 		 270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>