More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2762 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2762  NLPA lipoprotein  100 
 
 
280 aa  565  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10530  lipoprotein, YaeC family  59.84 
 
 
287 aa  317  1e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0281158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  49.62 
 
 
279 aa  265  8e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  44.44 
 
 
281 aa  205  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  44.2 
 
 
277 aa  202  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  44.74 
 
 
272 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  44.81 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.87 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  46.12 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  41.13 
 
 
288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  40.94 
 
 
265 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  45.53 
 
 
260 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  41.97 
 
 
278 aa  188  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  45.71 
 
 
259 aa  188  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  41.2 
 
 
278 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  43.35 
 
 
264 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  45.64 
 
 
257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  45.64 
 
 
257 aa  182  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  45.64 
 
 
257 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03095  outer membrane protein  45.27 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5165  NLPA lipoprotein  46.28 
 
 
261 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5222  NLPA lipoprotein  45.87 
 
 
261 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  40 
 
 
292 aa  178  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  39.85 
 
 
284 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0840  NLPA lipoprotein  39.3 
 
 
273 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0121683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0856  NLPA lipoprotein  39.3 
 
 
273 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000425064  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  39.85 
 
 
284 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5072  NLPA lipoprotein  45.45 
 
 
311 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  43.62 
 
 
256 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  39.86 
 
 
268 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  43.62 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  43.62 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  39.3 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  39.08 
 
 
279 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  44.44 
 
 
260 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  44.03 
 
 
257 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3165  NLPA lipoprotein  43.65 
 
 
259 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  43.27 
 
 
262 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  43.33 
 
 
263 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  45.45 
 
 
260 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  43.39 
 
 
256 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0300  NLPA lipoprotein  44.21 
 
 
261 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102131 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  38.6 
 
 
270 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2507  lipoprotein, YaeC family  43.9 
 
 
261 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  38.46 
 
 
271 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.6 
 
 
270 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3764  NLPA lipoprotein  41.11 
 
 
265 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  40.99 
 
 
260 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3160  YaeC family lipoprotein  43.9 
 
 
261 aa  169  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  40.99 
 
 
260 aa  169  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  38.25 
 
 
270 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  37.32 
 
 
268 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  38.25 
 
 
270 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  38.6 
 
 
270 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  39.36 
 
 
261 aa  168  7e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0807  NLPA lipoprotein  38.19 
 
 
286 aa  168  7e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0223  NLPA lipoprotein  44.76 
 
 
265 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270071  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.6 
 
 
270 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.68 
 
 
268 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.68 
 
 
268 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  38.6 
 
 
270 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  37.68 
 
 
268 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  37.32 
 
 
268 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  37.86 
 
 
277 aa  167  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  37.32 
 
 
268 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.6 
 
 
270 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  38.6 
 
 
270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.89 
 
 
270 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.32 
 
 
268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2841  YaeC family lipoprotein  43.09 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.215194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  37.76 
 
 
271 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  37.76 
 
 
271 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  37.76 
 
 
271 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  37.76 
 
 
271 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  37.76 
 
 
271 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  38.11 
 
 
271 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  41.11 
 
 
260 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  36.96 
 
 
268 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0491  ABC transporter, substrate-binding protein  39.11 
 
 
270 aa  165  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.345427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1176  hypothetical protein  47.3 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  38.08 
 
 
273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1072  lipoprotein 28  41.08 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  40.56 
 
 
272 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  36.69 
 
 
267 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  36.69 
 
 
267 aa  162  6e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  41.74 
 
 
256 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.8 
 
 
272 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.8 
 
 
272 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.24 
 
 
272 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.8 
 
 
272 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  40.8 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.8 
 
 
272 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  40.8 
 
 
272 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  37.68 
 
 
268 aa  161  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  37.74 
 
 
276 aa  160  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  45.68 
 
 
257 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.36 
 
 
268 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  35.4 
 
 
274 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13010  hypothetical protein  46.06 
 
 
259 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  39.45 
 
 
283 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>