More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1999 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  100 
 
 		 267 aa  543  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  100 
 
 		 267 aa  543  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1799  hypothetical protein  58.62 
 
 		 259 aa  312  2.9999999999999996e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1798  hypothetical protein  58.62 
 
 		 259 aa  312  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  53.53 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.98 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.98 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.98 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.98 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.98 
 
 		 271 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  54.85 
 
 		 265 aa  264  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  49.81 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.81 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.81 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  49.81 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.81 
 
 		 271 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  49.81 
 
 		 271 aa  260  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.81 
 
 		 271 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.81 
 
 		 271 aa  260  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  50.19 
 
 		 271 aa  259  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  55.6 
 
 		 265 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  49.62 
 
 		 270 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.43 
 
 		 271 aa  259  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  53.72 
 
 		 265 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  54.01 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.61 
 
 		 271 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  51.54 
 
 		 271 aa  256  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  50 
 
 		 275 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  53.59 
 
 		 264 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  53.59 
 
 		 264 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  53.33 
 
 		 270 aa  255  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  51.15 
 
 		 271 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  51.15 
 
 		 271 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  51.15 
 
 		 271 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  47.6 
 
 		 271 aa  254  9e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  47.6 
 
 		 271 aa  254  9e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  53.59 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  53.33 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  54.01 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  51.15 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  50.38 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  50.38 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  47.6 
 
 		 271 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  53.16 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  50.39 
 
 		 268 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  47.47 
 
 		 271 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  52.32 
 
 		 264 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  53.45 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  53.45 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.04 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  53.45 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  53.45 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  53.45 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.04 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  53.45 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.04 
 
 		 271 aa  249  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  53.45 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  48.31 
 
 		 271 aa  248  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  53.16 
 
 		 265 aa  248  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  53.02 
 
 		 272 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3536  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  51.98 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784209  normal  0.0236747 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  51.45 
 
 		 268 aa  246  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  48.55 
 
 		 286 aa  244  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  47.58 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  51.25 
 
 		 529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  50.21 
 
 		 268 aa  242  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  50.42 
 
 		 268 aa  242  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  51.25 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  51.25 
 
 		 268 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  52.32 
 
 		 266 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  52.32 
 
 		 266 aa  239  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  52.32 
 
 		 266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  50.83 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1612  lipoprotein, YaeC family  51.9 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  47.37 
 
 		 270 aa  238  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  49.17 
 
 		 297 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  49.17 
 
 		 268 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  48.52 
 
 		 264 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004240  methionine ABC transporter substrate-binding protein  47.37 
 
 		 269 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  49.17 
 
 		 268 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  49.6 
 
 		 269 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  50 
 
 		 268 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  44.79 
 
 		 264 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  47.33 
 
 		 258 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1359  YaeC family lipoprotein  46.99 
 
 		 270 aa  234  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  51.48 
 
 		 281 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01200  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  47.37 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  45.98 
 
 		 259 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  49.37 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5086  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  46.18 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.121383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  45.8 
 
 		 259 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4116  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  46.59 
 
 		 272 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0742418  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1652  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  52.74 
 
 		 266 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0044  lipoprotein, YaeC family  46.18 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  45.59 
 
 		 259 aa  231  8.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  48.52 
 
 		 258 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4168  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  46.18 
 
 		 272 aa  231  8.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4016  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  46.18 
 
 		 272 aa  231  9e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.651354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0787  D-methionine-binding lipoprotein metQ  45.38 
 
 		 266 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03486  hypothetical protein  46.8 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>