More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0491 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0491  ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 		 270 aa  533  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.345427  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0840  NLPA lipoprotein  82.78 
 
 		 273 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0121683  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0856  NLPA lipoprotein  82.78 
 
 		 273 aa  452  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000425064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2924  NLPA lipoprotein  55.6 
 
 		 279 aa  298  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.112237  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4694  ABC transporter, substrate-binding protein  54.81 
 
 		 270 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.825996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3580  NLPA lipoprotein  56.3 
 
 		 268 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.196099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4853  ABC transporter substrate-binding protein  54.81 
 
 		 270 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5220  ABC transporter substrate-binding protein  54.81 
 
 		 270 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5090  putative ABC transporter, substrate-binding protein  54.81 
 
 		 270 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5125  putative ABC transporter, substrate-binding protein  54.81 
 
 		 270 aa  281  9e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4709  ABC transporter, substrate-binding protein  54.81 
 
 		 270 aa  281  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4807  NLPA lipoprotein  54.81 
 
 		 270 aa  280  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5122  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  55.02 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5124  putative ABC transporter, substrate-binding protein  55.02 
 
 		 268 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4852  ABC transporter substrate-binding protein  54.65 
 
 		 268 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5219  ABC transporter substrate-binding protein  54.65 
 
 		 268 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0113  putative ABC transporter, substrate-binding protein  54.44 
 
 		 270 aa  279  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0233603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5127  putative ABC transporter, substrate-binding protein  54.44 
 
 		 270 aa  279  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.46965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5089  putative ABC transporter, substrate-binding protein  55.39 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5123  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  54.44 
 
 		 270 aa  278  5e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4708  ABC transporter, substrate-binding protein  55.19 
 
 		 268 aa  278  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0114  putative ABC transporter, substrate-binding protein  55.39 
 
 		 268 aa  278  6e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0830208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4806  NLPA lipoprotein  56.3 
 
 		 268 aa  278  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3077  NLPA lipoprotein  57.43 
 
 		 283 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  54.28 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.668941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4693  ABC transporter, substrate-binding protein  54.28 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1773  NLPA lipoprotein  49.63 
 
 		 270 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861841 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1395  NLPA lipoprotein  49.06 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0859  NLPA lipoprotein  49.63 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  45.71 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0641  hypothetical protein  46.77 
 
 		 256 aa  219  5e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  45.15 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  45.52 
 
 		 257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  44.78 
 
 		 257 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  43.12 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  42.38 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  41.28 
 
 		 278 aa  205  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  42.38 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  42.38 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  42.38 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  41.64 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  41.64 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  40.07 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  41.64 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  42.96 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  43.21 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  41.91 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  44.31 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.97 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.97 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.97 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.97 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  42.97 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.97 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  41.56 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  41.35 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  40.3 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.57 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  40.29 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  42.57 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1247  nlpa lipoprotein  41.09 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  39.92 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  41.98 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  39.04 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  41.3 
 
 		 270 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  42.4 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  42.5 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.02 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  41.57 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  42.74 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0127  NLPA lipoprotein  43.15 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.455916  normal  0.0556111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  42.74 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  41.91 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  42.62 
 
 		 258 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0648  NLPA lipoprotein  41.27 
 
 		 273 aa  188  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  41.74 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  38.76 
 
 		 272 aa  188  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5260  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  42.75 
 
 		 257 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  42.22 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  41.15 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  43.39 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  38.52 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  40.91 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3250  putative TonB-dependent receptor  38.57 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.112964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  39.46 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  39.46 
 
 		 258 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  40.08 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0272  NLPA lipoprotein  36.46 
 
 		 288 aa  185  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0970  NLPA family lipoprotein  44.61 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  41.22 
 
 		 262 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  41.48 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  39.53 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0283  NLPA lipoprotein  41.64 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  40.34 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  38.2 
 
 		 264 aa  182  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3526  lipoprotein, YaeC family  38.8 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2126  NLPA lipoprotein  37.82 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  38.08 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2103  D-methionine-binding lipoprotein metQ  37.91 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.83423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0253  NLPA lipoprotein  39.3 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.844943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>