More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2302 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2302  NLPA lipoprotein  100 
 
 
301 aa  594  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197407  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0249  NLPA lipoprotein  52.13 
 
 
304 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  54.98 
 
 
323 aa  289  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4336  NLPA lipoprotein  53.99 
 
 
314 aa  285  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  54.37 
 
 
301 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1651  NLPA lipoprotein  46.2 
 
 
291 aa  259  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3651  NLPA lipoprotein  50.54 
 
 
316 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0699  metal ion ABC transporter periplasmic protein  47.64 
 
 
326 aa  252  7e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0411  NLPA lipoprotein  49.12 
 
 
300 aa  241  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580913  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.21 
 
 
280 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  40.21 
 
 
284 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  40.21 
 
 
284 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  40.21 
 
 
280 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.21 
 
 
284 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  40.21 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40 
 
 
284 aa  215  8e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  40.55 
 
 
284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  40.21 
 
 
284 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  37.46 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  35.69 
 
 
281 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  35.11 
 
 
286 aa  176  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3533  NLPA lipoprotein  34.48 
 
 
272 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.16791  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  42.13 
 
 
263 aa  166  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  37.1 
 
 
274 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  37.45 
 
 
327 aa  163  3e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  35.94 
 
 
278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1597  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  34.95 
 
 
282 aa  162  6e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.128331  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  36.3 
 
 
278 aa  161  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  37.93 
 
 
280 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  37.93 
 
 
280 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  37.39 
 
 
266 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  42.93 
 
 
260 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  42.16 
 
 
257 aa  159  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  39.39 
 
 
292 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1510  NLPA lipoprotein  35.34 
 
 
269 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1509  NLPA lipoprotein  36.36 
 
 
266 aa  158  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1390  NLPA lipoprotein  41.37 
 
 
312 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130276  hitchhiker  0.00486036 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  36.13 
 
 
279 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  32.36 
 
 
300 aa  156  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.52 
 
 
286 aa  155  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  35.17 
 
 
266 aa  155  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  35.86 
 
 
279 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  38.98 
 
 
276 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0933  ABC transport system substrate-binding protein  41.53 
 
 
285 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.510052  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  37.82 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  40.47 
 
 
262 aa  152  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  37.71 
 
 
258 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3162  NLPA lipoprotein  43.13 
 
 
279 aa  152  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  34.75 
 
 
300 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  41 
 
 
258 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  40.68 
 
 
260 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  38.19 
 
 
265 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0420  NLPA lipoprotein  33.22 
 
 
317 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  36.49 
 
 
271 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  35.98 
 
 
284 aa  149  5e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  36.32 
 
 
283 aa  149  6e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  39.63 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  34.98 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  34.31 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40.49 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  32.92 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0867  NLPA lipoprotein  38.05 
 
 
270 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666915  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  36.63 
 
 
272 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  33.58 
 
 
271 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  34.78 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  37.39 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  33.94 
 
 
271 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  38.03 
 
 
267 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.82 
 
 
271 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.82 
 
 
271 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  38.03 
 
 
267 aa  146  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  36.19 
 
 
270 aa  146  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.82 
 
 
271 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.82 
 
 
271 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  33.94 
 
 
271 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.82 
 
 
271 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  35.02 
 
 
278 aa  145  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  36.63 
 
 
272 aa  145  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  36.63 
 
 
281 aa  145  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1240  NLPA family lipoprotein  35.81 
 
 
257 aa  145  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0276  NLPA lipoprotein  31.02 
 
 
275 aa  145  6e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  33.58 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  41.47 
 
 
272 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  33.97 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  33.58 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  33.58 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  31.64 
 
 
274 aa  145  9e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1641  YaeC family protein  34.27 
 
 
274 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.481009  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2126  NLPA lipoprotein  31.95 
 
 
267 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0793  NLPA family lipoprotein  36.28 
 
 
257 aa  145  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.074775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  33.82 
 
 
260 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0863  NLPA family lipoprotein  35.81 
 
 
257 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0971  protein of unknown function/lipoprotein, putative  32.76 
 
 
282 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  33.19 
 
 
283 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.39 
 
 
271 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>