More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0099 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  100 
 
 		 281 aa  551  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  81.43 
 
 		 280 aa  444  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  81.43 
 
 		 280 aa  444  1.0000000000000001e-124  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  55.91 
 
 		 280 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  56.27 
 
 		 280 aa  294  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  56.27 
 
 		 280 aa  294  9e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  54.42 
 
 		 284 aa  289  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  54.42 
 
 		 284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  54.42 
 
 		 284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  54.42 
 
 		 284 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  54.06 
 
 		 284 aa  288  6e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  54.42 
 
 		 284 aa  288  9e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  53.71 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  53.71 
 
 		 284 aa  285  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  38.57 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3533  NLPA lipoprotein  41.92 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.16791  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.8 
 
 		 284 aa  202  6e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  45.3 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1509  NLPA lipoprotein  40.6 
 
 		 266 aa  189  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  41.09 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  39.19 
 
 		 283 aa  186  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0362  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  42.64 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1585  NLPA lipoprotein  38.24 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255778  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1506  NLPA lipoprotein  41.15 
 
 		 266 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  40.42 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1510  NLPA lipoprotein  38.85 
 
 		 269 aa  185  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  41.67 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  41.67 
 
 		 271 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  41.67 
 
 		 271 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  41.67 
 
 		 271 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  45 
 
 		 327 aa  182  7e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  41.67 
 
 		 271 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.55 
 
 		 270 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  44.09 
 
 		 281 aa  181  9.000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  41.98 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  41.56 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  39.93 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0276  NLPA lipoprotein  38.83 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  38.66 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1651  NLPA lipoprotein  37.72 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  41.8 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  38.81 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  38.81 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  41.22 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  39.02 
 
 		 259 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  45.87 
 
 		 261 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  40.66 
 
 		 258 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  37.24 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  37.24 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1597  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  38.3 
 
 		 282 aa  175  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.128331  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  37.59 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  38.19 
 
 		 286 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  45.93 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  45.41 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  39.39 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  42.06 
 
 		 281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.06 
 
 		 272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.06 
 
 		 272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.06 
 
 		 272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.06 
 
 		 272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.06 
 
 		 272 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0699  metal ion ABC transporter periplasmic protein  40.57 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0249  NLPA lipoprotein  35.47 
 
 		 304 aa  171  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  40 
 
 		 270 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  39.02 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.63 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  41.63 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1102  D-methionine ABC transporter, periplasmic methionine-binding protein  37.12 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  41.39 
 
 		 529 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  42.51 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4336  NLPA lipoprotein  37.07 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  36.84 
 
 		 264 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  42.67 
 
 		 268 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  42.24 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  38.29 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0792  NLPA family lipoprotein  41.11 
 
 		 256 aa  168  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.070932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  39.72 
 
 		 281 aa  168  8e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  37.5 
 
 		 270 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1233  NLPA lipoprotein  38.31 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  38.15 
 
 		 262 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  39.83 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.64 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1241  NLPA family lipoprotein  40.71 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.518382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2302  NLPA lipoprotein  37.55 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  40.95 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1535  outer membrane lipoprotein 1 precursor  38.01 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  41.59 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  42.17 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0411  NLPA lipoprotein  40.24 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580913  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  41.85 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0862  NLPA family lipoprotein  40.71 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.929091  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  37.31 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  35.98 
 
 		 258 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  41.23 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.12 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  39.91 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  37.16 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  38.43 
 
 		 263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  36.74 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  36.74 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>