More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0364 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  100 
 
 		 286 aa  573  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  58.04 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  59.69 
 
 		 286 aa  318  7e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0362  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  52.43 
 
 		 287 aa  315  4e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  50.88 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  51.22 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  55.64 
 
 		 281 aa  278  8e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  49.61 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  49.03 
 
 		 327 aa  229  3e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  42.41 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0971  protein of unknown function/lipoprotein, putative  42.41 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  41.77 
 
 		 283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1597  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  39.66 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.128331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1641  YaeC family protein  42.86 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.481009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  42.75 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  40.62 
 
 		 286 aa  186  4e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.89 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.52 
 
 		 284 aa  185  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  40.15 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  40.15 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  42.01 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.15 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  40.52 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5040  NLPA lipoprotein  41.96 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.300245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  39.41 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  40.52 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.52 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0867  NLPA lipoprotein  38.76 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  38.97 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  39.34 
 
 		 271 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  39.34 
 
 		 271 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  39.34 
 
 		 271 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  41.08 
 
 		 266 aa  175  9e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  38.97 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  39.71 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  38.97 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0157  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  39.56 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  34.57 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  39.18 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  39.75 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  39.75 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.75 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.75 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.75 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.75 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.75 
 
 		 272 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  40.85 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  38.93 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  40 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  37.41 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3533  NLPA lipoprotein  40.09 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.16791  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  37.55 
 
 		 278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1510  NLPA lipoprotein  38.65 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1233  NLPA lipoprotein  38.2 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  38.11 
 
 		 258 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  36.05 
 
 		 264 aa  158  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  34.96 
 
 		 259 aa  157  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1506  NLPA lipoprotein  35.13 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1509  NLPA lipoprotein  36.56 
 
 		 266 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.12 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.36 
 
 		 271 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.36 
 
 		 271 aa  155  9e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  34.59 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0276  NLPA lipoprotein  34.88 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.98 
 
 		 271 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  36.88 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  36.88 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.98 
 
 		 271 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.88 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.88 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.88 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.12 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  36.12 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4336  NLPA lipoprotein  37.91 
 
 		 314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.12 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.88 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.74 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  36.21 
 
 		 276 aa  152  7e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  35.25 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.88 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.88 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.88 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  38.52 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.88 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.88 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.89 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  34.59 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.99 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  37.1 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  34.89 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  34.89 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1585  NLPA lipoprotein  38.12 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255778  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  34.89 
 
 		 270 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  34.04 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  37.1 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  34.59 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  32.58 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.14 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.69 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  35.25 
 
 		 270 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>