More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0340 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1597  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  49.82 
 
 		 282 aa  296  3e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.128331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0971  protein of unknown function/lipoprotein, putative  47.72 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  45.49 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  45.45 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  46.85 
 
 		 286 aa  223  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.31 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1641  YaeC family protein  41.4 
 
 		 274 aa  223  4e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.481009  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  46.74 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.87 
 
 		 286 aa  218  7.999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  42.97 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  38.11 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  35.56 
 
 		 323 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.46 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.11 
 
 		 284 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.76 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  37.76 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  37.76 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.76 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0362  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.97 
 
 		 287 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  35.45 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  38.46 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  37.06 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  38.46 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  38.46 
 
 		 284 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3533  NLPA lipoprotein  37.08 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.16791  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  37.79 
 
 		 280 aa  175  9e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  38.4 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  38.29 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  38.29 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  38.29 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  39.86 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  41.2 
 
 		 266 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5040  NLPA lipoprotein  36.97 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.300245 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  40 
 
 		 279 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0276  NLPA lipoprotein  33.45 
 
 		 275 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  37.59 
 
 		 278 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  40.25 
 
 		 279 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  37.89 
 
 		 271 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  37.89 
 
 		 271 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  34.13 
 
 		 283 aa  158  8e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  37.89 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  37.54 
 
 		 271 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  37.54 
 
 		 271 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  37.54 
 
 		 271 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  37.41 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36.71 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  36 
 
 		 259 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  36.71 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  36.71 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  36.71 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1651  NLPA lipoprotein  35.34 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.06 
 
 		 270 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  34.15 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  36.93 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36.71 
 
 		 270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36.71 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  37.06 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  36 
 
 		 259 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  36.84 
 
 		 271 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0157  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  34.59 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  36 
 
 		 278 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  37.85 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  37.85 
 
 		 281 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  36.3 
 
 		 266 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  38.08 
 
 		 263 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.85 
 
 		 272 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.85 
 
 		 272 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.85 
 
 		 272 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.85 
 
 		 272 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  35.21 
 
 		 282 aa  149  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.85 
 
 		 272 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  35.97 
 
 		 259 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  35.95 
 
 		 256 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  33.58 
 
 		 275 aa  149  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0867  NLPA lipoprotein  34.51 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.05 
 
 		 272 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3651  NLPA lipoprotein  38.3 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  35.21 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.92 
 
 		 271 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  35.92 
 
 		 271 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.92 
 
 		 271 aa  145  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  33.33 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.92 
 
 		 271 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  35.92 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  34.48 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1510  NLPA lipoprotein  32.53 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  34.48 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.34 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  32.99 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.92 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.92 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  35.92 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  35.92 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  37.64 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1233  NLPA lipoprotein  34.27 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.98 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.98 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.27 
 
 		 271 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>