More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0193 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 283 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  59.01 
 
 		 284 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  60.77 
 
 		 281 aa  328  5.0000000000000004e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  60.48 
 
 		 286 aa  308  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  55.48 
 
 		 300 aa  300  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0362  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  50 
 
 		 287 aa  290  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  50.88 
 
 		 286 aa  272  6e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  52.12 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  51.21 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  45.49 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1597  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.8 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.128331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0971  protein of unknown function/lipoprotein, putative  44.79 
 
 		 282 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1641  YaeC family protein  45.56 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.481009  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  41.15 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  38.74 
 
 		 283 aa  196  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  42.07 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  41.7 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  41.7 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  41.7 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  41.33 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  41.33 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  43.01 
 
 		 271 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  42.97 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  42.8 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  42.8 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  43.21 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.8 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.8 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.8 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  44.03 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.8 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.8 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  39.19 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.98 
 
 		 272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1798  hypothetical protein  38.06 
 
 		 259 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  39.49 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1799  hypothetical protein  38.06 
 
 		 259 aa  182  6e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  38.13 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  39.38 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  39 
 
 		 284 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  38.85 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.07 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.72 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.72 
 
 		 284 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.64 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0276  NLPA lipoprotein  35.9 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  37.45 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  40.49 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  39.68 
 
 		 271 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  36.92 
 
 		 278 aa  176  5e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  37.97 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  37.97 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  40.78 
 
 		 270 aa  175  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  38.26 
 
 		 280 aa  175  8e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  37.59 
 
 		 284 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.97 
 
 		 284 aa  175  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  38.26 
 
 		 280 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.81 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  37.63 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.63 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5040  NLPA lipoprotein  38.52 
 
 		 275 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.300245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  35.91 
 
 		 286 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0867  NLPA lipoprotein  38.04 
 
 		 270 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.666915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  38.78 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0157  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  37.06 
 
 		 274 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004240  methionine ABC transporter substrate-binding protein  41.32 
 
 		 269 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  40.49 
 
 		 266 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  37.5 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.5 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.5 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  37.5 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.5 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.8 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.5 
 
 		 271 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  34.98 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  37.13 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.13 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.43 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.43 
 
 		 271 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.13 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  38.06 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  38.71 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  38.71 
 
 		 280 aa  167  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.16 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.16 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.16 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  36.29 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.16 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.16 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.43 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.8 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  38.06 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1535  outer membrane lipoprotein 1 precursor  38.24 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.16 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  38.06 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  38.06 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  39.56 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  38.87 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.43 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.06 
 
 		 271 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>