More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004240 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004240  methionine ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 269 aa  540  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01200  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  90.33 
 
 		 269 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  76.58 
 
 		 269 aa  415  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0427  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  81.41 
 
 		 275 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3536  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  72.32 
 
 		 271 aa  394  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784209  normal  0.0236747 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  69 
 
 		 271 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  69 
 
 		 271 aa  391  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69 
 
 		 271 aa  391  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69 
 
 		 271 aa  391  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69 
 
 		 271 aa  391  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  68.63 
 
 		 271 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69 
 
 		 271 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  68.63 
 
 		 271 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69 
 
 		 271 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69 
 
 		 271 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  68.63 
 
 		 271 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69 
 
 		 271 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  68.63 
 
 		 271 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  69 
 
 		 271 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  66.42 
 
 		 271 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  66.79 
 
 		 271 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  66.79 
 
 		 271 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  67.16 
 
 		 271 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  67.16 
 
 		 271 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  67.16 
 
 		 271 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  66.79 
 
 		 271 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  66.79 
 
 		 271 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  66.42 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  58.67 
 
 		 271 aa  340  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3984  YaeC family lipoprotein  61.89 
 
 		 270 aa  317  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.22307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1359  YaeC family lipoprotein  60.4 
 
 		 270 aa  315  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1776  lipoprotein, YaeC family  56.65 
 
 		 271 aa  311  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1370  lipoprotein, YaeC family  55.51 
 
 		 271 aa  311  9e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0640926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3873  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  56.22 
 
 		 272 aa  298  5e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0039  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  56.22 
 
 		 272 aa  298  5e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1535  outer membrane lipoprotein 1 precursor  53.99 
 
 		 276 aa  298  7e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0044  lipoprotein, YaeC family  56.22 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4168  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  56.22 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4016  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  56.22 
 
 		 272 aa  297  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.651354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5086  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  56.22 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.121383 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03544  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  54.04 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03486  hypothetical protein  54.04 
 
 		 272 aa  296  3e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4116  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  55.42 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0742418  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0046  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  55.82 
 
 		 266 aa  289  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  53.85 
 
 		 275 aa  267  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  50.96 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  50.96 
 
 		 266 aa  250  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  47.37 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  47.37 
 
 		 267 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  49.62 
 
 		 271 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  48.87 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  51.49 
 
 		 262 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  48.87 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  48.5 
 
 		 271 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  50.63 
 
 		 264 aa  244  9e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  48.5 
 
 		 271 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  48.5 
 
 		 271 aa  244  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.05 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  51.05 
 
 		 281 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.05 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.05 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.05 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  51.05 
 
 		 272 aa  243  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  47.37 
 
 		 271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  50.63 
 
 		 272 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  50.21 
 
 		 272 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  47.72 
 
 		 286 aa  236  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  45.69 
 
 		 264 aa  235  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  46.18 
 
 		 266 aa  234  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  46.56 
 
 		 270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  46.64 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  48.75 
 
 		 270 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  48.1 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  47.35 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  44.44 
 
 		 271 aa  228  9e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  46.84 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  45.08 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  45.83 
 
 		 529 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  45.63 
 
 		 270 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  45.08 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  47.48 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  43.13 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  43.13 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  46.42 
 
 		 265 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  46.79 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  49.79 
 
 		 265 aa  222  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  42.75 
 
 		 259 aa  221  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  41.89 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  46.22 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  46.03 
 
 		 259 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  43.51 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  47.86 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1798  hypothetical protein  44.4 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1799  hypothetical protein  44.4 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  51.05 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  41.51 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3792  YaeC family lipoprotein  46.44 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293535  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1102  D-methionine ABC transporter, periplasmic methionine-binding protein  46.5 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  41.42 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  50.21 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>