More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1776 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1776  lipoprotein, YaeC family  100 
 
 		 271 aa  555  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1370  lipoprotein, YaeC family  93.36 
 
 		 271 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0640926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1359  YaeC family lipoprotein  75.65 
 
 		 270 aa  417  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0046  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  74.3 
 
 		 266 aa  397  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256696  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0044  lipoprotein, YaeC family  73.9 
 
 		 272 aa  388  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4016  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  73.9 
 
 		 272 aa  387  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.651354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0039  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  73.9 
 
 		 272 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3873  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  73.9 
 
 		 272 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4168  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  73.9 
 
 		 272 aa  388  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03544  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  73.9 
 
 		 272 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03486  hypothetical protein  73.9 
 
 		 272 aa  386  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5086  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  73.09 
 
 		 272 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.121383 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4116  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  72.69 
 
 		 272 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0742418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  64.58 
 
 		 271 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  64.94 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.58 
 
 		 271 aa  368  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.58 
 
 		 271 aa  368  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.58 
 
 		 271 aa  368  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  64.58 
 
 		 271 aa  368  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.94 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.94 
 
 		 271 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.21 
 
 		 271 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.58 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.58 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.58 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.58 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.58 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  64.58 
 
 		 271 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  62.73 
 
 		 271 aa  361  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  62.73 
 
 		 271 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  63.1 
 
 		 271 aa  359  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.99 
 
 		 271 aa  358  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  63.1 
 
 		 271 aa  358  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.25 
 
 		 271 aa  351  8e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.25 
 
 		 271 aa  350  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  61.25 
 
 		 271 aa  350  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  58.53 
 
 		 271 aa  318  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004240  methionine ABC transporter substrate-binding protein  56.65 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3984  YaeC family lipoprotein  56.88 
 
 		 270 aa  296  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.22307  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.61 
 
 		 269 aa  288  7e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01200  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  56.65 
 
 		 269 aa  285  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3536  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  54.23 
 
 		 271 aa  281  8.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.784209  normal  0.0236747 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0427  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  56.65 
 
 		 275 aa  266  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1535  outer membrane lipoprotein 1 precursor  51.31 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  42.44 
 
 		 267 aa  221  9e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  42.44 
 
 		 267 aa  221  9e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2102  lipoprotein YaeC  44.98 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000812987  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1799  hypothetical protein  44.05 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1798  hypothetical protein  44.05 
 
 		 259 aa  216  5e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  46.33 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  46.33 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  45.56 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  44.44 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  45.56 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  45.56 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1905  lipoprotein, YaeC family  44.86 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.279671  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  45.17 
 
 		 271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  43.3 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  43.96 
 
 		 271 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  45.87 
 
 		 281 aa  208  8e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.87 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.87 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.87 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.87 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.87 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  48.48 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  48.31 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  42.25 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  45.45 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  45.45 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  41.86 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  41.95 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  46.86 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  44.58 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  43.93 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2551  lipoprotein YaeC  43.98 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  40.85 
 
 		 281 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  43.02 
 
 		 271 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3792  YaeC family lipoprotein  42.48 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293535  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  43.22 
 
 		 270 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  41.85 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0863  lipoprotein, YaeC family  41.85 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136461  normal  0.522332 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  41.31 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  41.31 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  42.97 
 
 		 281 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  43.19 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  43.62 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  45.34 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  42.03 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0736  lipoprotein YaeC  43.02 
 
 		 264 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.356479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  43.8 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  43.93 
 
 		 266 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0941  YaeC family lipoprotein  45.45 
 
 		 264 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  44.96 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  45.38 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  45.19 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0778  lipoprotein YaeC  42.15 
 
 		 268 aa  192  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  43.39 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  41.57 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  40.54 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>