More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0277 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  100 
 
 
286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0276  NLPA lipoprotein  43.4 
 
 
275 aa  236  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  42.4 
 
 
286 aa  208  8e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3533  NLPA lipoprotein  46.67 
 
 
272 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.16791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  43.62 
 
 
266 aa  206  5e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1509  NLPA lipoprotein  43.95 
 
 
266 aa  202  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0362  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  42.45 
 
 
287 aa  201  8e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1510  NLPA lipoprotein  42.98 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  41.15 
 
 
283 aa  200  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  42.8 
 
 
284 aa  199  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1506  NLPA lipoprotein  39.36 
 
 
266 aa  199  6e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  44.49 
 
 
274 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.51 
 
 
300 aa  198  7.999999999999999e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  45.87 
 
 
258 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  43.44 
 
 
264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  42.17 
 
 
281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  45.23 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  40.81 
 
 
284 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0997  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  45.23 
 
 
265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.903774  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  40.81 
 
 
284 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  40.81 
 
 
284 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.81 
 
 
284 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2986  lipoprotein, YaeC family  45.23 
 
 
265 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.00263956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  40.34 
 
 
271 aa  189  5.999999999999999e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  39.93 
 
 
267 aa  188  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  40.59 
 
 
280 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  43.09 
 
 
278 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  40.44 
 
 
284 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.07 
 
 
284 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  41.94 
 
 
271 aa  187  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.44 
 
 
284 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.94 
 
 
271 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.94 
 
 
271 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.94 
 
 
271 aa  187  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  40.08 
 
 
270 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  41.94 
 
 
271 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.94 
 
 
271 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  43.03 
 
 
262 aa  186  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.22 
 
 
280 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  41.94 
 
 
271 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.94 
 
 
271 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.94 
 
 
271 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  40.22 
 
 
280 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  41.13 
 
 
270 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.53 
 
 
271 aa  186  4e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.97 
 
 
271 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.97 
 
 
271 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.97 
 
 
271 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.97 
 
 
271 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  40.62 
 
 
286 aa  186  5e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.97 
 
 
271 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.31 
 
 
271 aa  185  9e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  39.31 
 
 
271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  40.69 
 
 
276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  39.68 
 
 
272 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  42.74 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3386  putative outermembrane signal peptide protein  41.7 
 
 
529 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000211663  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  42.62 
 
 
281 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.94 
 
 
271 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.97 
 
 
271 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  37.93 
 
 
271 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.53 
 
 
271 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  39.83 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  40.66 
 
 
259 aa  182  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1233  NLPA lipoprotein  38.54 
 
 
275 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  41.46 
 
 
278 aa  181  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1127  NLPA lipoprotein  40.57 
 
 
281 aa  181  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3593  lipoprotein, YaeC family  40.74 
 
 
268 aa  181  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000081124  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  39.92 
 
 
270 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  35.45 
 
 
300 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  37.89 
 
 
284 aa  180  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  36.46 
 
 
271 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  41.77 
 
 
271 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  40.25 
 
 
259 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  39.34 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  41.6 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0888  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  38.54 
 
 
269 aa  178  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  40.91 
 
 
262 aa  178  9e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  36.46 
 
 
267 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  36.46 
 
 
267 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  41.06 
 
 
263 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  37.63 
 
 
278 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004240  methionine ABC transporter substrate-binding protein  40.66 
 
 
269 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  41.25 
 
 
257 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  41.37 
 
 
266 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  40.59 
 
 
263 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  39.92 
 
 
268 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0582  lipoprotein YaeC  41.49 
 
 
264 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0937  YaeC family lipoprotein  41.91 
 
 
264 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1061  YaeC family lipoprotein  41.49 
 
 
264 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1020  YaeC family lipoprotein  41.49 
 
 
264 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0792  lipoprotein, YaeC family  44.4 
 
 
266 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.375673 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  41.37 
 
 
266 aa  177  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0922  signal peptide protein  43.75 
 
 
266 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.928357  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4174  ABC metal ion transporter, periplasmic ligand binding protein  41.91 
 
 
264 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436245  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  37.76 
 
 
283 aa  176  3e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  35.21 
 
 
323 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  40.7 
 
 
327 aa  177  3e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  37.98 
 
 
273 aa  176  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40.91 
 
 
259 aa  176  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>