More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1199 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  100 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0362  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  41.61 
 
 		 287 aa  218  7.999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  39.01 
 
 		 283 aa  216  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.31 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  45.93 
 
 		 286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0276  NLPA lipoprotein  42.7 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  41.94 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  41.94 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  41.22 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  41.22 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  44.76 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  41.22 
 
 		 271 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  40.86 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.82 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  40.86 
 
 		 271 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  42.04 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.63 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  41 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  41.63 
 
 		 281 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.63 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.63 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.63 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.63 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  41.63 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  36.93 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.19 
 
 		 280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.33 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  42.63 
 
 		 327 aa  189  2.9999999999999997e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  39.75 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  36.93 
 
 		 279 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  39.15 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  38.06 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  38.58 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  39.75 
 
 		 270 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  38.58 
 
 		 280 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  40.15 
 
 		 271 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1510  NLPA lipoprotein  37.36 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  43.75 
 
 		 270 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1585  NLPA lipoprotein  37.68 
 
 		 287 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255778  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.95 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  37.5 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  38.72 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.09 
 
 		 284 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  39.92 
 
 		 267 aa  186  5e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5216  lipoprotein, NLPA family  41.85 
 
 		 260 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  39.42 
 
 		 264 aa  185  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  40.09 
 
 		 284 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  40.09 
 
 		 284 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2539  YaeC family lipoprotein  41.49 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00124943  normal  0.0921723 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  39.22 
 
 		 284 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  36.26 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.09 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1597  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.46 
 
 		 282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.128331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  39.65 
 
 		 256 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  38.33 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  40.52 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1233  NLPA lipoprotein  36.2 
 
 		 275 aa  182  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  36.93 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  36.93 
 
 		 258 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  39.74 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  35.53 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  35.98 
 
 		 266 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  40.25 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1515  lipoprotein, YaeC family  40.66 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2342  YaeC family lipoprotein  40.66 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.216371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  37 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  37 
 
 		 280 aa  179  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1509  NLPA lipoprotein  36.19 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  38.17 
 
 		 258 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.8 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0196  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36.93 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0177  ABC transporter substrate-binding protein  36.93 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000167969  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0167  NLPA family lipoprotein  36.93 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4856  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  38.84 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.407958 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0175  ABC transporter substrate-binding protein  36.93 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0104149  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1506  NLPA lipoprotein  37.76 
 
 		 266 aa  177  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  34.8 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  34.87 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  34.96 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  34.07 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  37.4 
 
 		 286 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  35.62 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  35.25 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  38.4 
 
 		 258 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0328  NLPA lipoprotein  40.36 
 
 		 260 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.255227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  37.6 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  39.33 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1908  NLPA lipoprotein  36.26 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000935112  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  38.77 
 
 		 260 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.19 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1976  membrane protein  39.21 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000011268  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  38.27 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  36.4 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0157  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  34.33 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  37.98 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5040  NLPA lipoprotein  34.1 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.300245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  38.33 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0067  NLPA lipoprotein  37.89 
 
 		 257 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  37.76 
 
 		 259 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3271  lipoprotein, YaeC family  37.34 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0000895864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>