More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1597 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1597  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.128331  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0971  protein of unknown function/lipoprotein, putative  64.89 
 
 
282 aa  379  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  49.82 
 
 
300 aa  296  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1641  YaeC family protein  50 
 
 
274 aa  247  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.481009  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  47.01 
 
 
327 aa  228  9e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  43.8 
 
 
283 aa  218  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  46.06 
 
 
286 aa  211  9e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.57 
 
 
284 aa  209  5e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  45.04 
 
 
300 aa  204  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  41.84 
 
 
281 aa  199  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  40.74 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  40.91 
 
 
280 aa  186  5e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0362  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  38.71 
 
 
287 aa  182  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  34.17 
 
 
323 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  38.8 
 
 
283 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  38.3 
 
 
281 aa  176  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.59 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  37.23 
 
 
280 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0888  NLPA lipoprotein  38.6 
 
 
277 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  38.08 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  37.23 
 
 
280 aa  172  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  39.45 
 
 
286 aa  172  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.55 
 
 
284 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  39.62 
 
 
259 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  38.08 
 
 
271 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.55 
 
 
284 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  38.08 
 
 
271 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  38.08 
 
 
271 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  37.55 
 
 
284 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  37.11 
 
 
271 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  37.18 
 
 
284 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  38.08 
 
 
271 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  37.18 
 
 
284 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  37.37 
 
 
271 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  37.37 
 
 
271 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  39.25 
 
 
259 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  37.09 
 
 
278 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.18 
 
 
284 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  36.82 
 
 
284 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  35.97 
 
 
284 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.71 
 
 
270 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  38.04 
 
 
263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  35.71 
 
 
270 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001625  methionine ABC transporter substrate-binding protein  36.71 
 
 
267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  38 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0737  YaeC family lipoprotein  38.11 
 
 
259 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  39.36 
 
 
281 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1651  NLPA lipoprotein  36.99 
 
 
291 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.36 
 
 
272 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.36 
 
 
272 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.36 
 
 
272 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.36 
 
 
272 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  39.36 
 
 
272 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2017  NLPA lipoprotein  37.15 
 
 
276 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000260343 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  39.36 
 
 
272 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  39.6 
 
 
260 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  39.22 
 
 
256 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  36.07 
 
 
280 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  36.07 
 
 
280 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  38.55 
 
 
272 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  37.01 
 
 
270 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1509  NLPA lipoprotein  34.63 
 
 
266 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  36.07 
 
 
266 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  37.59 
 
 
265 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08260  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.64 
 
 
282 aa  156  4e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.311717  normal  0.604931 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1510  NLPA lipoprotein  35.34 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2302  NLPA lipoprotein  34.03 
 
 
301 aa  155  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197407  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72640  putative TonB-dependent receptor  36.3 
 
 
260 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1233  NLPA lipoprotein  35.44 
 
 
275 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  37.46 
 
 
270 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0403  NLPA lipoprotein  35.18 
 
 
291 aa  152  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.203818  normal  0.319988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6306  putative TonB-dependent receptor  36.3 
 
 
260 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  36.36 
 
 
268 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0276  NLPA lipoprotein  32.62 
 
 
275 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  36.73 
 
 
258 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  36.73 
 
 
258 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  37.45 
 
 
258 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3343  YaeC family lipoprotein  36.96 
 
 
268 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00298632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1575  YaeC family lipoprotein  37.5 
 
 
262 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.528341  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0226  YaeC family lipoprotein  37.35 
 
 
268 aa  149  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.951808 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  34.38 
 
 
297 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  36.14 
 
 
279 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  36.8 
 
 
258 aa  149  7e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2126  NLPA lipoprotein  35.46 
 
 
267 aa  148  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  37.2 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  37.6 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  36.48 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1506  NLPA lipoprotein  35.34 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  35.39 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4767  YaeC family lipoprotein  36.58 
 
 
268 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5310  YaeC family lipoprotein  36.58 
 
 
268 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5116  NLPA lipoprotein  39.91 
 
 
256 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000552346  normal  0.122785 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5426  YaeC family lipoprotein  36.96 
 
 
268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263894  normal  0.429699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4843  YaeC family lipoprotein  36.96 
 
 
268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0157  ABC methionine transporter, periplasmic ligand binding protein  34.51 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.619051  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0112  metal ABC transporter periplasmic-binding protein  39.91 
 
 
256 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0445984  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  38.22 
 
 
258 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2810  NLPA lipoprotein  34.32 
 
 
272 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0129  NLPA lipoprotein  39.91 
 
 
256 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385968  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5436  lipoprotein YaeC  36.58 
 
 
268 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>