More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4336 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4336  NLPA lipoprotein  100 
 
 
314 aa  620  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  60.31 
 
 
323 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2302  NLPA lipoprotein  55.92 
 
 
301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197407  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1651  NLPA lipoprotein  46.45 
 
 
291 aa  248  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0699  metal ion ABC transporter periplasmic protein  47.1 
 
 
326 aa  231  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  43.33 
 
 
301 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3651  NLPA lipoprotein  46.3 
 
 
316 aa  225  6e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0411  NLPA lipoprotein  47.22 
 
 
300 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580913  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0249  NLPA lipoprotein  44.14 
 
 
304 aa  215  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  38.16 
 
 
284 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  38.16 
 
 
284 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  38.16 
 
 
284 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.81 
 
 
284 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  37.81 
 
 
284 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  36.92 
 
 
280 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  37.46 
 
 
284 aa  201  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  38.16 
 
 
284 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  36.92 
 
 
280 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  36.92 
 
 
280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  35.69 
 
 
284 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.54 
 
 
284 aa  171  2e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  36.05 
 
 
281 aa  169  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  37.64 
 
 
327 aa  168  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3533  NLPA lipoprotein  34.62 
 
 
272 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.16791  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  38.7 
 
 
300 aa  163  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  40.34 
 
 
263 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  37.77 
 
 
286 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  38.08 
 
 
270 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  41.59 
 
 
260 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  37.04 
 
 
266 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  41.12 
 
 
257 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  36.68 
 
 
266 aa  158  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  40.08 
 
 
260 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  38.33 
 
 
262 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  35.85 
 
 
286 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  37.71 
 
 
258 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  36.86 
 
 
258 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  33.94 
 
 
280 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  33.94 
 
 
280 aa  155  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  36.86 
 
 
258 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  38.08 
 
 
270 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  36.19 
 
 
267 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  36.19 
 
 
267 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  37.91 
 
 
286 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  37.21 
 
 
264 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  37.3 
 
 
270 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3301  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  40 
 
 
259 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.462058  normal  0.569217 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  38.31 
 
 
271 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1143  YaeC family lipoprotein  38.14 
 
 
262 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  37.9 
 
 
271 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  37.9 
 
 
271 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  36.5 
 
 
274 aa  152  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6507  lipoprotein, YaeC family  35.56 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  39.91 
 
 
280 aa  152  7e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  33.68 
 
 
283 aa  152  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  37.9 
 
 
281 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.9 
 
 
272 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.9 
 
 
272 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.9 
 
 
272 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  37.1 
 
 
271 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.9 
 
 
272 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1509  NLPA lipoprotein  34.51 
 
 
266 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  37.1 
 
 
271 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.9 
 
 
272 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  37.1 
 
 
271 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  35 
 
 
283 aa  151  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  37.67 
 
 
281 aa  151  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6094  lipoprotein, YaeC family  35.54 
 
 
279 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69551 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0565  lipoprotein YaeC  36.17 
 
 
258 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  35.58 
 
 
271 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  37.5 
 
 
272 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4333  hypothetical protein  36.02 
 
 
258 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.325394  normal  0.0616758 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1506  NLPA lipoprotein  31.68 
 
 
266 aa  149  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  32.84 
 
 
278 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  37.1 
 
 
272 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1614  NLPA lipoprotein  39.92 
 
 
261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.141443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0783  YaeC family lipoprotein  38.99 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1597  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  31.9 
 
 
282 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.128331  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1510  NLPA lipoprotein  33.6 
 
 
269 aa  146  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4505  NLPA lipoprotein  37.12 
 
 
256 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  33.46 
 
 
278 aa  145  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3223  lipoprotein YaeC  35.44 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  33.72 
 
 
258 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  34.87 
 
 
271 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  35.42 
 
 
278 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  38.25 
 
 
264 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0971  protein of unknown function/lipoprotein, putative  33.92 
 
 
282 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0276  NLPA lipoprotein  29.89 
 
 
275 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  34.73 
 
 
271 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2191  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  34.1 
 
 
268 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.654196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0420  NLPA lipoprotein  29.8 
 
 
317 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2175  YaeC family lipoprotein  35.94 
 
 
259 aa  143  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  36.29 
 
 
272 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  33.8 
 
 
281 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  31.16 
 
 
300 aa  142  7e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2087  YaeC family lipoprotein  35.55 
 
 
259 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2243  YaeC family lipoprotein  39.08 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.567581  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  35.22 
 
 
265 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2134  D-methionine-binding lipoprotein metQ  32.96 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  35.59 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>