More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0699 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0699  metal ion ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
326 aa  655    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0249  NLPA lipoprotein  46.23 
 
 
304 aa  251  8.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  50.19 
 
 
301 aa  239  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2302  NLPA lipoprotein  45.21 
 
 
301 aa  235  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197407  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0411  NLPA lipoprotein  50.18 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580913  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  39.68 
 
 
323 aa  232  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4336  NLPA lipoprotein  47.1 
 
 
314 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3651  NLPA lipoprotein  46.91 
 
 
316 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1651  NLPA lipoprotein  43.17 
 
 
291 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  41.82 
 
 
280 aa  216  5e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  41.45 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.58 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  40.43 
 
 
284 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  40.43 
 
 
284 aa  212  7e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.43 
 
 
284 aa  212  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.43 
 
 
284 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  40.94 
 
 
280 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  40.79 
 
 
284 aa  209  7e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  40.07 
 
 
284 aa  205  7e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  38.77 
 
 
284 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  38.15 
 
 
281 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3533  NLPA lipoprotein  38.75 
 
 
272 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.16791  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  39.03 
 
 
280 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  39.03 
 
 
280 aa  159  7e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0844  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.88 
 
 
284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000873096  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0360  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  35.25 
 
 
300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1041  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.94 
 
 
271 aa  151  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000114817  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  39.44 
 
 
281 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1510  NLPA lipoprotein  38 
 
 
269 aa  151  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3789  lipoprotein, YaeC family  38.55 
 
 
274 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0876  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.91 
 
 
271 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00171435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3407  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.57 
 
 
271 aa  150  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0430128  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1094  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.57 
 
 
271 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174386  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.09 
 
 
271 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.09 
 
 
271 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.09 
 
 
271 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.09 
 
 
271 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  40 
 
 
278 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  36.09 
 
 
271 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  34.06 
 
 
286 aa  149  7e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3755  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.94 
 
 
271 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000728433  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16970  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.36 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0646398  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  37.92 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0845  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  33.82 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000174258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1233  NLPA lipoprotein  37.45 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  32.96 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0361  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  36.44 
 
 
286 aa  146  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  34.96 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1509  NLPA lipoprotein  36.18 
 
 
266 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.96 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0430  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  37.86 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.268327  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.96 
 
 
271 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  33.09 
 
 
271 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0735  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.21 
 
 
271 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.005469  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  34.47 
 
 
278 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  33.93 
 
 
266 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  32.73 
 
 
271 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  34.59 
 
 
271 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.59 
 
 
271 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.59 
 
 
271 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.59 
 
 
271 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  34.59 
 
 
271 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2654  NLPA lipoprotein  36.14 
 
 
276 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  34.21 
 
 
271 aa  142  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  39.15 
 
 
262 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1772  NLPA lipoprotein  34.48 
 
 
265 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1370  lipoprotein, YaeC family  35.12 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0640926  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  35.25 
 
 
327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  35.95 
 
 
270 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0193  NLPA lipoprotein  32.32 
 
 
283 aa  139  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.200781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5369  YaeC family lipoprotein  37.29 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0173047 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  35.42 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  38.84 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1506  NLPA lipoprotein  33.76 
 
 
266 aa  139  7e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  35.43 
 
 
286 aa  139  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  35.54 
 
 
278 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0362  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  31.54 
 
 
287 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  33.73 
 
 
280 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1770  lipoprotein YaeC  35.56 
 
 
264 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  35.95 
 
 
270 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4605  YaeC family lipoprotein  34.71 
 
 
272 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0162892  normal  0.447885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0197  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  30.43 
 
 
270 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000066517  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0360  lipoprotein, YaeC family  35.04 
 
 
273 aa  136  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1073  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  40.19 
 
 
260 aa  137  4e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5126  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.58 
 
 
270 aa  136  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1999  methionine-binding protein  36.18 
 
 
267 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.344493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0197  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  36.18 
 
 
267 aa  136  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0219  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.22 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0161  NLPA lipoprotein  30.82 
 
 
270 aa  135  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1542  NLPA lipoprotein  38.53 
 
 
258 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.524941  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0431  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  34.24 
 
 
281 aa  135  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00235434  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0199  putative ABC transporter, substrate-binding protein  30.58 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1069  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  34.94 
 
 
261 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0562  NLPA lipoprotein  35.71 
 
 
263 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0046  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  34.15 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256696  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2125  NLPA lipoprotein  32.62 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3221  NLPA lipoprotein  36.89 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.219486  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  35.95 
 
 
270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  35 
 
 
271 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1102  D-methionine ABC transporter, periplasmic methionine-binding protein  34.81 
 
 
272 aa  134  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>