More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0420 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0420  NLPA lipoprotein  100 
 
 
317 aa  627  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2302  NLPA lipoprotein  36.21 
 
 
301 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197407  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23460  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  30.96 
 
 
323 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00650145  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4960  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.01 
 
 
284 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0360  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.67 
 
 
284 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0345  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.63 
 
 
284 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0343  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.26 
 
 
284 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0299  ABC transporter substrate-binding protein  29.63 
 
 
284 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0314  ABC transporter substrate-binding protein  29.63 
 
 
284 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0286  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  31.17 
 
 
280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0283  lipoprotein ABC transporter substrate-binding protein  31.17 
 
 
280 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0387  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.17 
 
 
280 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0294  NLPA lipoprotein  28.89 
 
 
284 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0293  NLPA lipoprotein  30.3 
 
 
284 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1651  NLPA lipoprotein  29.37 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4336  NLPA lipoprotein  29.5 
 
 
314 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0249  NLPA lipoprotein  32.19 
 
 
304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0960  YaeC family lipoprotein  29.79 
 
 
278 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2783  YaeC family lipoprotein  30.45 
 
 
258 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0099  ABC transporter, substrate-binding protein  28.84 
 
 
281 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3533  NLPA lipoprotein  29.39 
 
 
272 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.16791  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0558  lipoprotein, YaeC family  31.85 
 
 
270 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0046  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  30.13 
 
 
266 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.256696  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7228  outer membrane lipoprotein  31.85 
 
 
266 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1390  NLPA lipoprotein  35.41 
 
 
312 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.130276  hitchhiker  0.00486036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4158  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  31.45 
 
 
270 aa  123  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471961  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1370  lipoprotein, YaeC family  29.74 
 
 
271 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0640926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5162  lipoprotein, YaeC family  33.33 
 
 
257 aa  122  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1966  YaeC family lipoprotein  32.24 
 
 
271 aa  122  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4489  YaeC family lipoprotein  34.68 
 
 
260 aa  122  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0112568  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0761  YaeC family lipoprotein  31.67 
 
 
266 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  31.67 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0498  NLPA lipoprotein  27.6 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000880061  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0286  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  29.46 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00047573  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0132  ABC D-methionine uptake transporter, substrate-binding protein  29.15 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.597472  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0290  YaeC family lipoprotein  31.85 
 
 
270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0276  NLPA lipoprotein  28.97 
 
 
275 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  29.46 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0381792  normal  0.291732 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1768  YaeC family lipoprotein  29.15 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111673  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0267  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  29.46 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.217766  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1199  NLPA lipoprotein  27.91 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.806489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0485  NLPA lipoprotein  27.6 
 
 
280 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00253982  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0283  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  29.46 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.188868  normal  0.293421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0272  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  29.46 
 
 
271 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.922304  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0277  NLPA lipoprotein  29.72 
 
 
286 aa  120  3e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1485  lipoprotein, YaeC family  29.18 
 
 
281 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000129064  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4308  YaeC family lipoprotein  30.71 
 
 
264 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2750  YaeC family lipoprotein  30 
 
 
271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2890  YaeC family lipoprotein  30 
 
 
271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.065227  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0340  ABC transporter substrate-binding protein  34.78 
 
 
300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2220  lipoprotein YaeC  30 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.764878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2833  YaeC family lipoprotein  30 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2844  YaeC family lipoprotein  30 
 
 
271 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.568886  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22280  NLPA lipoprotein  30.45 
 
 
263 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00196  DL-methionine transporter subunit  30.56 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3405  lipoprotein, YaeC family  30.56 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000434725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00195  hypothetical protein  30.56 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00217092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3462  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  30.56 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000417542  normal  0.876119 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0191  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  30.56 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0075131  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0201  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  30.56 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.002525  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0411  NLPA lipoprotein  30.71 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.580913  normal  0.932385 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1396  YaeC family lipoprotein  30.04 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.760284  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0204  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  30.56 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000208912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0209  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  30.56 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.127497  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6163  lipoprotein YaeC  30 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0786  NLPA lipoprotein  33.04 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122075  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0364  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  30.95 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0208  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  30.09 
 
 
271 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0183748  normal  0.50615 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1771  YaeC family lipoprotein  31.78 
 
 
278 aa  117  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000675009  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5086  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  28.03 
 
 
272 aa  117  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.121383 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1359  YaeC family lipoprotein  28.87 
 
 
270 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5187  D-methionine-binding lipoprotein MetQ  32.24 
 
 
262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3285  D-methionine ABC transporter protein, periplasmic binding protein  30.96 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331481  normal  0.190767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2417  lipoprotein YaeC  31.51 
 
 
262 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.875733  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0470  YaeC family lipoprotein  29.64 
 
 
271 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970361 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1717  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface antigen  28.06 
 
 
327 aa  116  5e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3873  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  28.88 
 
 
272 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3183  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  30.65 
 
 
272 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0039  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  28.88 
 
 
272 aa  116  6e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0686  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  30.65 
 
 
272 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2864  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  30.65 
 
 
272 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0521  YaeC family lipoprotein  30.65 
 
 
281 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1437  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  30.65 
 
 
272 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.39891  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0155  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  30.65 
 
 
272 aa  116  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2603  lipoprotein, YaeC family  31.25 
 
 
260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.946899  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1906  NLPA lipoprotein  33.64 
 
 
280 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800256  normal  0.249416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03544  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  28.88 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0044  lipoprotein, YaeC family  28.88 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03486  hypothetical protein  28.88 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1945  lipoprotein YaeC  29.2 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.283148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0439  D-methionine ABC transporter, periplasmic D-methionine-binding protein  30.65 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4016  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  28.88 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.651354  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4168  cytoplasmic membrane lipoprotein-28  28.88 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3174  YaeC family lipoprotein  31.39 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0987485  hitchhiker  0.00336429 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0504  YaeC family lipoprotein  30.24 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7906  NlpA lipoprotein  31.34 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3501  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  30.05 
 
 
271 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000464416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4789  DL-methionine ABC transporter periplasmic-binding protein  30.4 
 
 
270 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3344  DL-methionine transporter substrate-binding subunit  29.56 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1233  NLPA lipoprotein  28.73 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>